若在存疑不起诉后又发现新的犯罪，司法机关会重新启动刑事诉讼程序，根据新发现的犯罪事实进行侦查、起诉和审判。具体来说，可以从以下几个角度来详细分析：

1. 存疑不起诉的法律含义：

   • 存疑不起诉，是指检察机关对于经过补充侦查的案件，仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉决定。这并不意味着犯罪嫌疑人完全无罪，而是基于现有证据无法证明其有罪。

2. 新犯罪事实的发现：

   • 如果在存疑不起诉后，又发现了新的犯罪事实或证据，这些新事实或证据可能足以证明原犯罪嫌疑人有罪，或者证明其涉及新的犯罪。

3. 司法程序的重启：

   • 一旦发现新的犯罪事实或证据，司法机关（通常是公安机关）会重新启动刑事诉讼程序。这包括对新犯罪事实的侦查、收集证据、提请逮捕（如果必要）、移送审查起诉等步骤。
   • 检察机关在收到新的证据和案件材料后，会重新审查案件，并根据新的事实和证据决定是否提起公诉。

4. 对原存疑不起诉的影响：

   • 新犯罪事实的发现并不直接撤销原存疑不起诉决定，但可能导致对原案件的重新审查。如果新证据足以证明原犯罪嫌疑人有罪，检察机关可能会撤销原不起诉决定，并提起公诉。
   • 同时，如果新发现的犯罪事实与原案件相关，司法机关可能会将两案合并处理，以确保案件的全面、公正审理。

5. 犯罪嫌疑人的权利与义务：

   • 在新的刑事诉讼程序中，犯罪嫌疑人仍然享有宪法和法律赋予的各项权利，如辩护权、申请回避权等。
   • 同时，犯罪嫌疑人也有义务配合司法机关的调查和审判工作，如实陈述事实，提供证据等。

建议：

• 如果您或您身边的人遇到这种情况，建议积极配合司法机关的调查工作，如实陈述事实，提供相关证据。
• 同时，也可以寻求专业法律帮助，以更好地维护自己的合法权益。

在处理这类复杂案件时，每个细节都可能对案件结果产生重大影响。因此，如果您有任何疑问或需要进一步的法律指导，请随时向我咨询。