结论：当法院判决诉讼费由被告支付给原告时，原告有权根据法院的相关规定和流程申请退还预先交纳的诉讼费。以下是对此问题的详细解答：
一、诉讼费用承担原则与退费依据
根据《诉讼费用交纳办法》第二十九条，诉讼费用原则上由败诉方负担，胜诉方自愿承担的除外。在判决中明确诉讼费由被告承担的情况下，被告应依法负担相应的诉讼费用。这意味着，如果原告已经预交了诉讼费用，且判决结果支持了原告的诉讼请求，那么原告有权申请退还这部分费用。
二、退费流程与操作指南
提交退费申请：
- 原告需在判决生效后，持生效判决书向法院的诉讼费退费窗口或相关负责部门提出书面退费申请。
- 申请时应填写退费申请表，详细注明案件信息、预交诉讼费金额及要求退费的理由。
法院审核：
- 法院会对原告的退费申请进行审核，确认判决中关于诉讼费承担的内容，并核实原告预交诉讼费的凭证和信息。
- 审核过程中，法院会确认申请人的身份和缴费情况，确保退费申请的合法性与准确性。
退费执行：
- 经审核无误后，法院将按照财务规定办理退费手续，并在合理时间内将诉讼费退还给原告。
- 退费的具体时间和方式可能因地区和法院而异，但通常会通过银行转账等方式进行。
三、特殊情况处理与注意事项
调解结案或撤诉：
- 如果案件以调解方式结案或原告申请撤诉，根据《诉讼费用交纳办法》的相关规定，诉讼费用会减半收取。在这种情况下，如果诉讼费原本应由被告承担，但原告已预交，那么原告可以申请退还一半的诉讼费用（若判决中明确由被告承担全部费用，则可能全额退还，具体需根据判决内容确定）。
被告未履行判决：
- 若被告未履行判决支付诉讼费，这可能会影响退费的进度。但原告仍享有依法应获得的退费权利，法院将通过执行程序向被告追缴诉讼费以保障原告权益。
及时申请与材料齐全：
- 原告应在判决生效后尽快向法院提交退费申请，避免因拖延而错过申请时机或影响退费进度。
- 在申请退费时，应确保提交的材料完整且准确，包括判决书、身份证件、缴费票据等。缺失任何材料都可能导致退费申请被延迟或驳回。
关注法院通知：
- 在退费过程中，原告应密切关注法院的通知和指示，了解退费的最新进度和需要配合的事项。如有任何疑问或问题，应及时与法院沟通解决。
四、实例说明
假设原告在一场合同纠纷案件中胜诉，法院判决被告承担全部诉讼费用共计5000元。原告在案件审理过程中已预交了这5000元诉讼费用。判决生效后，原告可以向法院提交退费申请，并提供判决书、缴费凭证等相关材料。法院审核无误后，将按照财务规定办理退费手续，并在合理时间内将5000元诉讼费退还给原告。
总结与建议：当法院判决诉讼费由被告支付给原告时，原告应按照法院的相关规定和流程及时申请退还预先交纳的诉讼费。在申请过程中，应注意材料的完整性和准确性，并密切关注法院的通知以确保退费的顺利进行。如有任何疑问或问题，可以直接向我咨询。