结论：公司管理恶意员工后，员工辞职本身并不直接构成违法，但具体是否违法需根据辞职的原因、方式以及是否给公司造成损失等因素综合判断。
分析：
员工辞职的合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，员工有权依法解除劳动合同，即辞职。员工辞职通常只需提前通知公司（试用期提前三日，正式员工提前三十日），并办理相关离职手续，即可合法离职。
- 因此，从一般意义上讲，员工辞职是合法的行为，不构成违法。
恶意管理下的辞职：
- 如果公司对员工存在恶意管理行为，如侮辱、诽谤、非法限制人身自由等，员工有权因此提出辞职，并可能要求公司承担相应的法律责任。
- 在这种情况下，员工的辞职行为不仅合法，还可能构成对公司恶意管理行为的一种合理反抗。
辞职方式与后果：
- 如果员工在辞职过程中采取非法手段，如破坏公司财物、泄露公司机密等，则可能构成违法，需要承担相应的法律责任。
- 另外，如果员工未按照法律规定提前通知公司或未办理离职手续就擅自离职，给公司造成损失的，公司有权要求员工赔偿。
公司恶意管理的影响：
- 如果公司存在恶意管理行为，员工在辞职时可以主张因此受到的损害赔偿，包括但不限于精神损害赔偿、经济损失赔偿等。
- 员工还可以向劳动监察部门投诉公司的恶意管理行为，要求相关部门进行调查和处理。
建议：
- 对于员工而言，如果遭遇公司的恶意管理行为，应保留相关证据，如聊天记录、邮件、录音等，以便在辞职时或之后主张自己的权益。
- 在辞职时，员工应按照法律规定提前通知公司，并办理离职手续，避免给自己带来不必要的法律风险。
- 如果公司存在恶意管理行为且给员工造成损失的，员工可以向劳动仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼，要求公司承担相应的法律责任。
示例：
假设某公司对员工张三进行恶意管理，如经常无故辱骂张三、非法限制其人身自由等。张三因此决定辞职，并提前三十日向公司提交了书面辞职申请。在辞职过程中，张三未采取任何非法手段，也未给公司造成损失。那么，张三的辞职行为是合法的，且有权要求公司因其恶意管理行为承担相应的法律责任。
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