总公司项目由分公司实施，在符合一定条件下是合法的。这一结论主要基于分公司的法律地位、总公司的授权以及相关法律法规的规定。以下从多个角度进行详细分析：
一、分公司的法律地位与责任
分公司作为总公司的分支机构，通常不具有独立的法人资格，其民事责任由总公司承担。然而，分公司可以在总公司的授权范围内从事经营活动，包括以自己的名义对外签订合同和开展业务。这意味着，在一定条件下，总公司承接的项目可以由分公司来具体实施，但这一行为的合法性需基于明确的法律基础和总公司授权。
二、合法实施的条件
总公司授权：
- 总公司必须明确授权分公司实施项目，这可以通过内部的授权文件、项目合同中的明确条款或其他书面形式来实现。授权应明确分公司的实施范围、权限和责任，以确保分公司行为的合法性和有效性。
分公司资质与能力：
- 分公司需要具备实施项目所需的资质、人员、设备等条件。例如，如果项目涉及建筑施工活动，分公司则需要具备相应的建筑施工资质和安全生产条件。
合同约定与相对方同意：
- 如果项目合同中明确约定了由分公司来实施项目，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么这种安排是合法有效的。若合同最初未明确约定由分公司实施，但在项目实施过程中，总公司与合同相对方协商一致，取得了相对方的书面同意，也可以由分公司来实施项目。
不损害相对方利益：
- 总公司将项目交由分公司实施不能给合同相对方带来额外的风险或损失。例如，不能因为分公司的财务状况不佳而影响到项目款项的支付，也不能因为分公司的信誉问题而导致项目无法顺利实施。
三、非法实施的情形
未经授权的实施：
- 如果分公司未经总公司授权擅自实施项目，或者超越授权范围实施项目，这种行为可能构成违法或违约，总公司需承担相应的法律责任。
违反合同约定：
- 如果项目合同明确规定必须由总公司亲自实施，不得进行任何形式的分包或转包，那么分公司不能代替总公司实施项目，否则可能构成违约。
逃避法律责任或损害利益：
- 若总公司与分公司之间的项目实施行为涉嫌逃避法律责任、损害债权人利益、违反行业特定监管规则等情况，也可能被认定为不合法。
四、法律责任与风险防范
法律责任：
- 在分公司实施项目的过程中，如果发生违约或其他法律纠纷，总公司通常是法律责任主体。分公司作为总公司的附属机构，首先用其自身资金承担赔偿责任，不足部分则由总公司承担。
风险防范：
- 为确保合法性并降低风险，建议总公司在授权分公司实施项目时明确约定分公司的实施角色和权限，并及时向合同相对方披露相关信息。同时，分公司也应严格遵守总公司的授权范围和合同约定，以避免潜在的法律风险。
总结与建议：总公司项目由分公司实施是否合法，需根据具体情况和合同约定来判断。为确保合法性并降低风险，建议总公司在实施前进行充分的法律审查和风险评估，并在必要时咨询专业律师的意见。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。