工资不是由法人发放，并不能直接决定能否证明劳动关系，而是需要结合其他证据和实际情况进行综合判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 劳动关系确认的综合考量原则：

   • 劳动关系的确认并非仅依据工资发放方式，而是需要综合考虑劳动合同、工资支付记录、工作证、考勤记录、工作任务分配、同事或上级沟通记录等多方面证据。
   • 即使工资不是由法人直接发放，但如果存在其他能够证明劳动者接受用人单位管理、从事用人单位安排的有报酬的劳动，且该劳动是用人单位业务组成部分的相关证据，那么仍然可以认定存在劳动关系。

2. 可能认定存在劳动关系的情况：

   • 存在其他劳动关系佐证：除了工资发放记录外，如果还有工作证、工作服、考勤记录、同事证言、工作安排记录等能够证明劳动者与用人单位之间存在管理与被管理的关系，且劳动者的工作内容是用人单位业务的一部分，那么很可能被认定存在劳动关系。
   • 法人行为代表公司意志：如果法人以公司名义招聘员工，员工入职后按公司规章制度工作，且法人发放工资是在履行公司管理职责时，那么可以认为法人的行为代表公司意志，从而确认劳动关系。

3. 可能不被认定存在劳动关系的情况：

   • 缺乏劳动关系实质特征：如果没有其他证据证明劳动者与用人单位之间存在管理与被管理的关系，劳动者的工作内容并非用人单位业务组成部分，只是偶尔提供劳务并获得报酬，那么难以认定存在劳动关系。这种情况下更倾向于认定为劳务关系。
   • 法人个人行为与公司无关：如果能证明法人发放工资是其个人行为，并非代表公司意志，如法人与劳动者存在私人经济往来或合作关系，工资发放基于这种私人关系而与公司业务和管理无关，那么不能认定存在劳动关系。

4. 举证责任与法律后果：

   • 在劳动争议中，主张劳动关系存在的一方需承担举证责任。如果劳动者能提供足够证据证明劳动关系存在，而用人单位无法提供反证或合理解释个人账户转账行为的原因，仲裁机构或法院往往会认定双方存在劳动关系。
   • 一旦认定存在劳动关系，用人单位可能面临支付未签劳动合同二倍工资差额、经济补偿、补缴社会保险等法律责任。

举例说明：

• 假设某员工在公司工作，虽然工资是由法人的个人账户发放，但员工有公司的工作证、考勤记录，且在工作群中经常接受领导安排的任务并汇报工作，同时工资发放周期、金额固定并与工作表现关联。在这种情况下，即使工资不是由公司直接发放，也可以认定员工与公司之间存在劳动关系。

建议：

• 对于劳动者而言，如果工资不是由法人或公司直接发放，应尽可能收集其他能够证明劳动关系的证据，如工作证、考勤记录、同事证言等，以备不时之需。
• 对于用人单位而言，应规范工资发放方式，避免使用个人账户发放工资，以减少不必要的法律风险。同时，应与员工签订劳动合同，明确双方的权利和义务。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。