房屋买卖附加协议只有一方持有，从法律角度讲，这并不直接决定协议的合法性，但可能影响其证明力和执行效果。以下从不同角度为你详细分析：

1. 协议合法性的核心要素：

   • 房屋买卖附加协议，作为原买卖合同的补充或变更，其合法性主要取决于协议内容是否违反法律、行政法规的强制性规定，是否违背公序良俗，以及双方是否在平等、自愿的基础上达成一致。只要这些条件满足，协议就是合法的，无论协议文本由哪一方持有。

2. 协议持有情况对证明力的影响：

   • 在法律纠纷中，协议文本的持有情况可能影响其作为证据的证明力。如果只有一方持有协议，而另一方否认协议的存在或内容，那么持有协议的一方需要提供其他证据来佐证协议的真实性和合法性，如通过电子邮件、短信、录音等方式证明双方曾就协议内容进行过协商并达成一致。

3. 协议执行效果的风险：

   • 如果协议只有一方持有，且另一方不承认协议内容，那么在实际执行过程中可能会遇到困难。例如，在办理房屋过户手续时，如果买方持有附加协议要求卖方履行某些额外义务，而卖方不承认这些义务，那么买方可能需要通过法律途径来解决争议，这无疑会增加交易成本和风险。

4. 建议与措施：

   • 为了避免因协议持有情况而引发的法律纠纷，建议在签订房屋买卖附加协议时，双方应各执一份协议文本，并妥善保管。如果条件允许，还可以将协议进行公证或备案，以增强其法律效力和证明力。
   • 如果已经发生了只有一方持有协议的情况，建议持有协议的一方尽快与另一方沟通，尽量通过协商方式解决争议。如果协商无果，可以考虑通过法律途径来维护自己的合法权益，但在此过程中需要充分准备证据来证明协议的真实性和合法性。

总结来说，房屋买卖附加协议的合法性并不取决于协议文本的持有情况，但持有情况可能影响其证明力和执行效果。因此，在签订和履行协议过程中，双方应谨慎处理协议文本，确保各执一份并妥善保管，以避免不必要的法律纠纷。如果你在房屋买卖过程中遇到了相关问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。