房屋买卖仅有三方协议是否合法需分情况讨论，关键看协议内容是否符合法律强制性规定及是否完成法定登记手续。具体分析如下：

1. 若三方协议具备房屋买卖合同核心条款且不违反法律强制性规定，即使未签订标准制式合同，仍可能被认定为合法有效
   根据《民法典》第490条，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或按指印时合同成立。房屋买卖合同的核心条款包括：买卖双方身份信息、房屋基本状况（地址、面积、产权证号）、价款及支付方式、交付时间、过户时间、违约责任等。若三方协议（如包含买方、卖方、中介方）中明确约定了上述核心条款，且不存在《民法典》第143条规定的无效情形（如恶意串通损害他人利益、违反法律强制性规定等），则该协议具有法律效力，买卖双方需按协议履行义务。

2. 若三方协议缺乏核心条款或存在违法情形，可能被认定为无效或可撤销
   例如：协议未明确房屋价款、支付方式等关键条款，导致合同无法履行；或协议约定“规避税费”“绕过限购政策”等违法内容，根据《民法典》第153条，违反法律、行政法规强制性规定的合同无效。此外，若卖方隐瞒房屋已抵押、查封等事实，买方可依据《民法典》第148条主张撤销合同。

3. 仅签订三方协议未办理过户登记，房屋所有权不发生转移
   根据《民法典》第209条，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记发生效力。即使三方协议合法有效，若未办理房屋过户登记，买方仅享有债权请求权（可要求卖方配合过户），而非物权所有权。若卖方在此期间将房屋再次出售给第三人并完成过户，买方可能面临“一房二卖”风险，需通过诉讼主张违约赔偿。

给你的建议：

• 审查协议内容：核对协议是否包含房屋基本状况、价款、支付方式、过户时间等核心条款，确保无违法内容（如规避税费、限购等）。
  
• 尽快办理过户：若协议合法有效，督促卖方配合完成过户登记，避免所有权争议。
  
• 保留证据：保存付款凭证、沟通记录等，证明已履行合同义务，以防卖方违约。
  
• 咨询专业律师：若协议存在瑕疵或卖方拒不配合过户，可委托律师分析风险，通过诉讼确认合同效力、要求过户或赔偿损失。
  

如有具体协议条款或纠纷细节，可直接向我咨询，我会结合实际情况为你详细解答。