针对您提出的问题，即工伤认定书下来后，还需要进行二次手术，何时可以做伤残鉴定，以下是我为您提供的详细解答：

首先，要明确的是，伤残鉴定（劳动能力鉴定）通常是在工伤职工经过治疗后，伤情处于相对稳定状态，且存在残疾、影响劳动能力的情况下进行的。这是为了确认工伤原因造成的职工身体上的残疾程度，以及这种残疾对职工未来工作和生活的影响。

对于您的情况，既然还需要进行二次手术，那么说明您的伤情尚未完全稳定。在这种情况下，通常不建议立即进行伤残鉴定。因为二次手术可能会改变您的伤情状况，从而影响伤残鉴定的结果。

建议您在二次手术完成后，且伤情相对稳定后，再考虑进行伤残鉴定。具体来说，您可以等待手术伤口愈合，身体功能逐渐恢复，且经过一段时间的观察，确认伤情没有进一步恶化或变化后，再向设区的市级劳动能力鉴定委员会申请伤残鉴定。

在申请伤残鉴定时，您需要准备以下材料：

1. 有效的诊断证明和完整的病历材料，包括二次手术的相关记录；
2. 工伤职工的居民身份证或社会保障卡等其他有效身份证明原件。

此外，关于伤残鉴定的时限，劳动能力鉴定委员会通常会在收到申请之日起60日内作出鉴定结论。如果伤情复杂，这个期限可以延长30日。

最后，如果您对初次鉴定结论不服，可以在收到该鉴定结论之日起15日内，向省、自治区、直辖市劳动能力鉴定委员会申请再次鉴定。省、自治区、直辖市劳动能力鉴定委员会作出的劳动能力鉴定结论为最终结论。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。