结论前置：甲方向乙方协商做笔迹鉴定，这一行为本身在程序上是合乎情理的，但具体是否可行及后续操作需依据双方合同约定、争议情况及相关法律规定来综合判断。

详细分析：

1. 协商做笔迹鉴定的合法性：

   • 在合同纠纷中，如果双方对合同中某方的签字真实性存在争议，那么通过笔迹鉴定来确认签字真实性是一种合法且常见的解决方式。甲方作为合同的一方，有权提出对合同中乙方签字的真实性进行鉴定，但这一提议通常需要通过协商或法律程序来实现。
   • 协商是解决合同纠纷的一种友好方式，甲方可以与乙方就笔迹鉴定的事宜进行协商，包括鉴定的机构、费用承担、鉴定结果的法律效力等。如果双方能够达成一致，那么可以共同委托鉴定机构进行笔迹鉴定。

2. 协商不成时的法律程序：

   • 如果双方无法就笔迹鉴定达成一致，甲方可以考虑通过法律途径来解决争议。例如，甲方可以向法院提起诉讼，并在诉讼过程中申请法院委托鉴定机构进行笔迹鉴定。
   • 在诉讼过程中，法院会根据双方提供的证据和争议情况，决定是否需要进行笔迹鉴定，并指定相应的鉴定机构。鉴定结果将作为法院判决的重要依据。

3. 笔迹鉴定的法律效力：

   • 笔迹鉴定是一种科学的技术手段，其鉴定结果在法律上具有一定的证明力。但是，鉴定结果的法律效力并非绝对，法院在判决时会综合考虑其他证据和案件情况。
   • 如果笔迹鉴定结果显示合同中的签字并非乙方所签，那么这将对合同的效力产生重大影响，可能导致合同无效或可撤销。

4. 实际操作中的注意事项：

   • 在协商做笔迹鉴定时，双方应明确鉴定的目的、范围、机构选择等关键事项，并尽可能达成书面协议，以避免后续争议。
   • 如果选择通过法律途径解决争议，甲方应确保在诉讼过程中提供充分的证据支持其主张，并按照法院的要求配合进行笔迹鉴定。

法律建议：

• 如果甲方对合同中乙方的签字真实性存在疑问，建议首先与乙方进行友好协商，尝试通过协商方式解决争议。
• 如果协商不成，甲方可以考虑向法院提起诉讼，并在诉讼过程中申请法院委托鉴定机构进行笔迹鉴定。
• 在整个过程中，甲方应保留好相关证据，如合同原件、沟通记录等，以便在需要时提供证明。

后续行动指导：

• 如果您决定与乙方协商做笔迹鉴定，建议提前了解相关鉴定机构的资质和信誉，选择一家具有权威性和公信力的鉴定机构。
• 如果协商不成或您对协商结果不满意，建议及时咨询专业律师，了解您的法律权益和可能的法律途径，以便更好地维护您的合法权益。

如有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。