工伤职工在停工留薪期内请病假，公司扣员工工资是不合法的，且公司需按照原工资福利待遇继续支付。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《工伤保险条例》第三十三条的明确规定：

• 职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
• 停工留薪期一般不超过12个月。伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。

二、具体分析

1. 停工留薪期内的工资待遇：

   • 在停工留薪期内，工伤职工的原工资福利待遇是不变的，这意味着公司不能扣除工伤职工的工资。
   • 公司需要按照工伤职工原来的工资福利待遇，按月支付给工伤职工。

2. 停工留薪期的时长与延长：

   • 停工留薪期一般不超过12个月，但如果伤情严重或情况特殊，经过相关部门的确认，可以适当延长，但延长的期限也不得超过12个月。
   • 这确保了工伤职工有足够的时间进行康复和治疗，而不必担心工资问题。

3. 工伤医疗待遇的延续：

   • 如果工伤职工在停工留薪期满后仍需治疗，他们可以继续享受工伤医疗待遇。
   • 这进一步保障了工伤职工的医疗需求得到持续满足。

三、维权途径

如果公司违反了相关规定，扣除了工伤职工的工资，工伤职工可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 与公司协商：

   • 工伤职工可以与公司进行协商，要求公司补发被扣除的工资。

2. 申请劳动仲裁：

   • 如果协商不成，工伤职工可以向劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求公司支付被扣除的工资。

3. 向劳动监察部门投诉：

   • 工伤职工还可以向当地的劳动监察部门投诉，让劳动监察部门介入调查，并要求公司支付被扣除的工资。

四、特殊情况说明

• 如果工伤职工的停工留薪期已经结束，且经过劳动能力鉴定后，被认定为部分或完全丧失劳动能力，那么他们的工资待遇可能会根据伤残等级进行调整。但这与停工留薪期内的工资待遇是不同的，且调整后的工资待遇也应符合相关法律法规的规定。

总结：工伤职工在停工留薪期内请病假是受到法律保护的，公司不仅不能扣除其工资，还需按照原工资福利待遇继续支付。如果公司违反了相关规定，工伤职工有多种途径可以维护自己的合法权益。如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。