在工伤认定期间，公司一般不能随意扣除员工的病假工资或相关待遇，但具体情况需结合实际来判断。以下从不同角度为你详细分析：
法律角度
工伤认定期间的待遇保障：
- 根据《工伤保险条例》的相关规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这意味着，在工伤认定期间（通常包含在停工留薪期内），员工应享受与正常工作期间相同的工资待遇，公司不得随意扣除。
病假与工伤假的区别：
- 病假通常指员工因疾病或非因工负伤需要暂停工作接受治疗时，公司应给予的假期。而工伤假则是员工因工作原因受到伤害或患职业病时，应享受的特殊假期。在工伤认定期间，员工享受的是工伤假待遇，而非病假待遇。因此，公司不能以病假为由扣除员工的工资或相关待遇。
实际操作角度
公司规章制度：
- 虽然法律有明确规定，但具体执行时还需参考公司的规章制度。如果公司规章制度中明确规定了工伤认定期间的待遇标准，且该标准不低于法律规定的最低标准，那么公司应按照规章制度执行。然而，如果公司规章制度与法律相冲突，则应以法律为准。
证据保留：
- 作为员工，在工伤认定期间应妥善保留相关证据，如医疗证明、工伤认定申请书等。这些证据在后续维权过程中将起到关键作用。如果公司擅自扣除工资或相关待遇，员工可以凭借这些证据向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
特殊情况
- 如果员工在工伤认定期间存在违反公司规章制度或法律法规的行为（如旷工、故意破坏公司财物等），公司有权根据规章制度进行相应处理。但这种情况下的处理应与公司规章制度和法律法规相符，且不能随意扩大处理范围或加重处理力度。
建议
- 与公司沟通：如果公司试图在工伤认定期间扣除你的病假工资或相关待遇，建议首先与公司进行沟通，明确表达你的诉求和法律依据。
- 寻求法律援助：如果沟通无果，你可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。在此过程中，如有需要，可以随时向我咨询相关法律问题。
总之，在工伤认定期间，公司一般不能随意扣除员工的病假工资或相关待遇。如果遇到此类问题，建议员工先与公司沟通并保留好相关证据，必要时寻求法律援助。