被告若要反驳原告仅凭转账记录及公证书主张有合法依据，可以从以下几个角度进行抗辩：
转账记录的性质与目的：
- 非借贷关系：被告可以主张转账并非基于借贷关系，而是基于其他法律关系，如赠与、投资、合伙、委托理财、偿还之前债务等。根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》第十六条，原告仅依据金融机构的转账凭证提起民间借贷诉讼，被告抗辩转账系偿还双方之前借款或者其他债务的，被告应当对其主张提供证据证明。被告提供相应证据证明其主张后，原告仍应就借贷关系的成立承担举证责任。
- 缺乏借贷合意：强调转账记录本身并不能证明双方存在借贷的合意，即没有书面或口头的借款协议，也没有其他证据表明双方有借款的意图。
公证书的内容与效力：
- 公证书内容不完整或存在瑕疵：检查公证书的内容，如果公证书仅公证了转账记录的真实性，而未涉及转账的目的或性质，那么公证书并不能直接证明原告的主张。被告可以指出公证书的局限性，并要求原告提供更多证据来支持其主张。
- 公证书的证明力有限：公证书虽然具有一定的证明力，但它并不是绝对不可推翻的。如果被告能够提供相反的证据或理由，可以削弱公证书的证明力。
提供反证或反驳证据：
- 提供书面或口头协议：如果被告能够提供与转账相关的书面或口头协议，证明转账是基于其他法律关系，那么这将是对原告主张的有力反驳。
- 证人证言：寻找能够证明转账目的或性质的证人，如共同的朋友、亲戚或业务伙伴等，他们的证言可能有助于揭示转账的真实情况。
- 其他相关证据：如聊天记录、邮件、短信等，这些证据可能包含双方关于转账目的或性质的讨论，有助于证明被告的主张。
法律程序与举证责任：
- 强调原告的举证责任：在民事诉讼中，原告通常承担举证责任，即需要提供足够的证据来证明其主张。被告可以指出原告未能提供充分的证据来证明转账是基于借贷关系，从而要求法院驳回原告的诉讼请求。
- 利用法律程序进行抗辩：被告可以在答辩状中详细阐述其抗辩理由，并在庭审过程中积极举证、质证，以维护自己的合法权益。
在具体操作中，被告应注意以下几点：
- 及时收集并整理证据：被告应在收到起诉状后尽快收集并整理相关证据，以便在庭审过程中进行有力的抗辩。
- 咨询专业律师：虽然我作为王丰小律师已经提供了一些基本的法律建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，被告在应对此类纠纷时，最好咨询专业律师以获取更具体、更专业的法律帮助。
- 保持冷静与理性：在应对法律纠纷时，保持冷静与理性至关重要。被告应避免情绪化的回应或行为，以免对案件的解决产生不利影响。
若被告在反驳过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我将根据案件的具体情况提供有针对性的法律建议和帮助。