结论：要使房东因合同未标注租金含税而愿意赔偿所签订的协议具有法律效力，该协议需满足法律规定的合同生效要件，包括双方意思表示真实、协议内容合法合规、不违反公序良俗等。以下是从协议内容、形式及签订注意事项等角度给出的具体建议。
协议内容
明确赔偿事项：
- 协议中应明确说明，因原租赁合同未标注租金含税，现房东愿意就因此产生的税务问题（如补缴税款、滞纳金、罚款等）向承租人进行赔偿。
- 赔偿的具体金额或计算方式需详细列明，例如按照税务机关核定的税额的一定比例进行赔偿，或者约定一个固定的赔偿金额。
约定支付方式与期限：
- 协议中应明确赔偿金的支付方式（如一次性支付、分期支付等）和支付期限。
- 若选择分期支付，应详细列明每期的支付金额和支付时间。
税务责任划分：
- 协议中应明确，在房东支付赔偿金后，因原租赁合同未标注租金含税而产生的后续税务责任（如有）由哪一方承担。
- 例如，可以约定由房东承担全部税务责任，或者由双方按照一定比例分担。
违约责任：
- 协议中应包含违约责任条款，明确若一方未按照协议约定履行义务，应承担的违约责任（如支付违约金、赔偿损失等）。
争议解决方式：
- 协议中应约定争议解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。
- 若选择仲裁或诉讼，应明确仲裁机构或诉讼法院的具体名称。
协议形式
书面形式：
- 协议应以书面形式签订，以确保双方的权利义务得到明确记录。
- 书面协议应由双方签字或盖章确认，以证明双方对协议内容的认可。
合法合规：
- 协议内容应合法合规，不得违反法律法规的强制性规定。
- 例如，协议中不得约定逃避税务责任、损害国家利益或社会公共利益等条款。
签订注意事项
双方意思表示真实：
- 签订协议时，双方应确保意思表示真实，不存在欺诈、胁迫等情形。
- 若一方在签订协议时存在重大误解或显失公平等情形，可能影响协议的效力。
审查对方身份与资质：
- 在签订协议前，双方应审查对方的身份与资质，确保对方具有签订协议的资格和能力。
- 例如，房东应提供房产证等证明其房屋所有权的文件；承租人应提供身份证明等文件。
保留相关证据：
- 签订协议后，双方应保留好协议原件及相关证据（如支付凭证、沟通记录等），以备不时之需。
示例协议条款：
“鉴于原租赁合同未标注租金含税，现房东（甲方）愿意就因此产生的税务问题向承租人（乙方）进行赔偿。双方经友好协商，达成如下协议：
一、甲方同意向乙方支付赔偿金人民币XX元，作为对原租赁合同未标注租金含税的补偿。
二、赔偿金支付方式：甲方应于本协议签订之日起XX日内，将赔偿金一次性支付至乙方指定的银行账户。
三、税务责任划分：甲方支付赔偿金后，因原租赁合同未标注租金含税而产生的后续税务责任（如有）由甲方承担。
四、违约责任：若甲方未按照本协议约定支付赔偿金，应向乙方支付违约金人民币XX元，并赔偿乙方因此遭受的损失。
五、争议解决方式：本协议在履行过程中发生的争议，由双方协商解决；协商不成的，提交XX仲裁委员会仲裁或向XX人民法院起诉。
六、本协议一式两份，甲乙双方各执一份，自双方签字或盖章之日起生效。”
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。