结论：即使签了自愿离职协议，劳动者在符合法定情形时，仍然有权申请劳动仲裁以维护自身合法权益。以下是对此问题的详细分析：
一、自愿离职协议的法律效力
自愿离职协议本身是劳动者与用人单位就解除劳动关系达成的一致意见，一般情况下具有法律效力。然而，如果协议签订过程中存在欺诈、胁迫等情形，导致劳动者在违背真实意思的情况下签订协议，那么该协议可能被认定为无效或可撤销。
二、可申请劳动仲裁的具体情形
协议存在瑕疵或违法：
- 如果自愿离职协议签订时存在重大误解、显失公平，或者劳动者是在被欺诈、胁迫的情况下签订的，劳动者可以在知道或应当知道撤销事由之日起一年内申请撤销该协议，并通过劳动仲裁主张权益。例如，用人单位以不发工资、奖金，恶意诋毁声誉等方式逼迫劳动者签署离职协议，劳动者若能提供确凿证据，将极大增强胜诉的可能性。
- 协议内容未明确关键条款（如经济补偿金数额）或存在违法情形，劳动者也可申请劳动仲裁。根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位在解除劳动合同时，应当依法支付经济补偿金。如果协议中未明确经济补偿金数额或用人单位拒绝支付，劳动者有权通过劳动仲裁要求用人单位支付。
协议未履行或履行不符合约定：
- 用人单位未按协议约定支付经济补偿、工资、奖金等款项，或未办理相关离职手续（如档案转移、社保减员），劳动者可通过劳动仲裁要求用人单位履行义务。例如，协议中约定了用人单位应支付的经济补偿金数额，但用人单位未按时支付，劳动者可以申请劳动仲裁要求用人单位支付该款项。
用人单位存在违法行为：
- 在解除劳动合同过程中，如果用人单位存在未依法支付经济补偿、未足额支付劳动报酬、未依法缴纳社会保险等违法行为，劳动者可申请劳动仲裁追究其法律责任。根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位在解除劳动合同时，应当依法支付经济补偿金、足额支付劳动报酬并依法缴纳社会保险。如果用人单位存在违法行为，劳动者有权通过劳动仲裁要求用人单位承担相应的法律责任。
三、申请劳动仲裁的注意事项
保留证据：
- 劳动者应妥善保存与解除劳动合同相关的所有证据，包括协议文本、沟通记录、录音录像、证人证言等，以便在仲裁过程中证明自己的主张。例如，如果劳动者主张自己是在被胁迫的情况下签订离职协议的，那么录音录像、证人证言等证据将至关重要。
了解法律程序：
- 劳动者需熟悉劳动仲裁的相关法律程序和规定，确保申请符合法律要求。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动者申请劳动仲裁应当提交书面仲裁申请，并按照被申请人人数提交副本。仲裁申请书应当载明劳动者的姓名、性别、年龄、职业、工作单位和住所，用人单位的名称、住所和法定代表人或者主要负责人的姓名、职务，以及仲裁请求和所根据的事实、理由等。
注意仲裁时效：
- 申请劳动仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，劳动者应及时行使权利，避免超过时效。例如，如果劳动者在签订离职协议后发现用人单位存在违法行为，那么应当在知道或应当知道该违法行为之日起一年内申请劳动仲裁。
四、可能不被支持的情形
如果自愿离职协议是劳动者在充分了解法律规定和自身权益后，出于真实意愿签订的，且协议内容合法、用人单位已按约定履行义务，那么劳动者再以相同事由申请劳动仲裁，其请求可能不会得到仲裁委的支持。例如，如果劳动者在签订离职协议时明确放弃了经济补偿金等权益，并且用人单位已经按照协议约定履行了义务，那么劳动者再以未支付经济补偿金等为由申请劳动仲裁的，将可能不会被支持。
建议：如果你已经签订了自愿离职协议，但认为协议签订过程中存在欺诈、胁迫等情形，或者用人单位存在违法行为未履行协议义务，你可以及时收集证据并申请劳动仲裁以维护自身合法权益。如果你对劳动仲裁流程或相关法律规定不熟悉，可以直接向我咨询，我将为你提供专业的法律帮助。