结论：工地违法填河时，挖机驾驶员是否有责任需根据具体情况判断，可能涉及行政责任、民事责任甚至刑事责任。以下从不同角度详细分析：
一、行政责任角度
驾驶员作为直接实施者：
- 如果挖机驾驶员明知或应知填河行为违法，仍按照工地负责人或相关人员的指示进行操作，那么驾驶员可能因违反《中华人民共和国水法》、《中华人民共和国防洪法》等相关法律法规，面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
- 驾驶员在操作过程中，若未尽到合理的注意义务，导致填河行为对河流生态、防洪安全等造成严重影响，还可能被责令停止违法行为，并采取补救措施。
驾驶员与工地负责人的责任划分：
- 驾驶员作为直接操作人员，其责任通常较轻于工地负责人或组织者。但如果驾驶员在操作过程中存在故意或重大过失，如明知违法仍坚持操作，或操作过程中严重违反操作规程，那么其责任将相应加重。
- 工地负责人或组织者作为违法行为的策划者和指挥者，通常承担主要责任。驾驶员在承担行政责任的同时，工地负责人或组织者也将受到更严厉的行政处罚。
二、民事责任角度
驾驶员的侵权行为：
- 如果挖机驾驶员的填河行为导致河流生态破坏、周边土地受损或他人财产损失，那么驾驶员可能因侵权行为而承担民事赔偿责任。
- 赔偿范围通常包括直接损失（如修复费用、财产损失等）和间接损失（如因生态破坏导致的长期经济损失等）。
驾驶员与工地负责人的连带责任：
- 在某些情况下，驾驶员与工地负责人可能构成共同侵权，需要承担连带责任。这意味着受害人可以向驾驶员或工地负责人中的任何一方或双方要求赔偿。
- 连带责任的具体承担方式需根据案件具体情况和法院判决来确定。
三、刑事责任角度
驾驶员的犯罪行为：
- 如果挖机驾驶员的填河行为情节严重，构成犯罪（如非法占用农用地罪、破坏环境资源保护罪等），那么驾驶员将面临刑事处罚，如有期徒刑、拘役、罚金等。
- 刑事责任的承担需根据犯罪情节、社会危害程度等因素综合判断。
驾驶员与工地负责人的共犯关系：
- 如果驾驶员与工地负责人共同策划、实施填河行为，且均明知该行为违法，那么他们可能构成共犯，共同承担刑事责任。
- 在共犯关系中，驾驶员和工地负责人的责任划分需根据各自在犯罪中的作用、地位等因素来确定。
四、特殊情况考虑
驾驶员的知情权与抗辩权：
- 如果驾驶员在操作前对填河行为的违法性并不知情，或虽知情但因受到胁迫、欺诈等原因而不得不操作，那么驾驶员可能享有抗辩权，减轻或免除其责任。
- 驾驶员需提供充分证据证明其不知情或受到胁迫、欺诈等情形。
驾驶员的职务行为与个人行为：
- 如果驾驶员的填河行为属于职务行为（即按照工地负责人的指示或要求进行操作），那么其责任可能由工地负责人或所在单位承担。
- 但如果驾驶员的填河行为超出职务范围或属于个人行为，那么其需自行承担相应责任。
建议：
- 对于挖机驾驶员而言，在接到工地负责人或相关人员的填河指示时，应首先了解该行为是否合法，并评估可能面临的法律风险。
- 如果发现填河行为违法或可能对环境、他人财产造成损害，驾驶员应拒绝操作并及时向相关部门报告。
- 对于工地负责人或组织者而言，应严格遵守相关法律法规，不得违法填河或指示他人违法填河。否则，将面临严重的法律后果。
如有进一步疑问或需要具体法律建议，请直接向我咨询。