档案馆出具的加盖公章的复印件，在符合一定条件下，是可以作为行政诉讼证据的。以下从几个方面进行详细分析：
一、证据的合法性
在行政诉讼中，证据必须合法取得且符合法定形式。档案馆作为国家设立的保管档案资料的机构，其出具的加盖公章的复印件，在形式上具备了合法性的基础。公章的使用代表了档案馆对该复印件内容的认可，因此，从形式上看，这样的复印件是合法的证据形式。
二、证据的真实性
证据的真实性是证据被采纳的关键。档案馆出具的加盖公章的复印件，其真实性主要取决于原件的真实性以及复印过程的准确性。如果原件是真实的，且复印过程中没有篡改或伪造，那么这样的复印件就是真实的。在行政诉讼中，如果对方对复印件的真实性提出质疑，可能需要通过其他证据或鉴定手段来进一步确认。
三、证据的关联性
证据必须与案件事实具有关联性，才能被采纳为定案的依据。档案馆出具的加盖公章的复印件，如果与案件事实直接相关，比如是证明某个行政行为合法性的关键证据，那么这样的复印件就具有关联性，可以被采纳为证据。
四、特殊情况下的考虑
原件无法取得的情况：在某些情况下，原件可能由于各种原因无法取得，比如原件已经遗失或毁损。在这种情况下，如果档案馆出具的加盖公章的复印件能够证明案件事实，且没有其他相反证据推翻其真实性，那么这样的复印件是可以被采纳为证据的。
对方认可的情况：如果对方在行政诉讼中明确认可档案馆出具的加盖公章的复印件的真实性，那么这样的复印件自然可以作为证据使用，无需再进行额外的证明。
五、法律建议
确保证据的完整性和清晰度：在提交档案馆出具的加盖公章的复印件作为证据时，应确保证据的完整性和清晰度，避免因为复印质量或保存不当导致证据无法被采纳。
准备其他辅助证据：为了增强证据的说服力，可以准备其他辅助证据来支持复印件的真实性，比如原件的存放记录、复印过程的记录等。
咨询专业律师：虽然我在这里给出了基本的法律分析，但每个案件的具体情况都有所不同。如果你在行政诉讼中遇到相关问题，建议直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。
综上所述，档案馆出具的加盖公章的复印件，在符合一定条件下，是可以作为行政诉讼证据的。但具体能否被采纳，还需要根据案件的具体情况以及证据的真实性、合法性和关联性进行综合判断。