特殊疾病是否纳入劳动合同保护范围，需分情况讨论，具体如下：

1. 若特殊疾病属于职业病范畴：

   • 法律保护：根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，职业病是明确受到劳动合同保护的。这意味着，如果劳动者因工作原因患上职业病，其劳动合同的履行、变更、解除或终止都将受到法律的特殊保护。例如，用人单位不得因劳动者患职业病而单方面解除劳动合同，且需承担相应的治疗费用和赔偿责任。
   • 实际操作：在实际操作中，劳动者需首先进行职业病诊断，并由相关部门出具职业病诊断证明书。一旦确诊为职业病，劳动者即可依法享受相应的工伤保险待遇和劳动合同保护。

2. 若特殊疾病不属于职业病，但属于法定医疗期内的疾病：

   • 法律保护：根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，劳动者在医疗期内享有病假工资、医疗待遇等权益，且用人单位不得随意解除劳动合同。这里的“医疗期”是指劳动者因患病或非因工负伤停止工作治病休息，而用人单位不得因此解除劳动合同的时限。
   • 实际操作：劳动者需向用人单位提供医疗机构出具的病假证明，并按照用人单位的规定办理病假手续。在医疗期内，用人单位需按照相关规定支付病假工资，并保障劳动者的其他合法权益。

3. 若特殊疾病既不属于职业病，也不在法定医疗期内：

   • 法律保护相对有限：在这种情况下，劳动合同的保护范围可能相对有限。虽然劳动者仍享有基本的劳动权益，如获得劳动报酬、享受社会保险等，但用人单位在解除劳动合同时可能受到较少的法律限制。
   • 实际操作建议：劳动者应与用人单位进行充分沟通，说明自身情况，并尝试协商解决方案。如果双方无法达成一致，劳动者可以寻求劳动争议调解或仲裁机构的帮助，以维护自身合法权益。

额外建议：

• 了解相关法律法规：劳动者应主动了解与自身疾病相关的法律法规，以便在必要时维护自己的合法权益。
• 保留相关证据：在患病期间，劳动者应保留好医疗机构出具的诊断证明、病假证明等相关证据，以备不时之需。
• 及时沟通协商：与用人单位保持及时、有效的沟通，说明自身情况，并尝试协商解决方案，有助于减少不必要的劳动争议。

总结：特殊疾病是否纳入劳动合同保护范围，取决于疾病是否属于职业病或是否在法定医疗期内。劳动者应根据自身情况，了解相关法律法规，保留相关证据，并与用人单位进行及时沟通协商，以维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。