员工辞职后，劳动合同的处理是一个既涉及法律义务又关乎双方权益保护的重要环节。以下是从用人单位和劳动者两方面，结合相关法律法规，为您详细阐述劳动合同的正确处置方式。

用人单位方面

1. 接收并确认辞职报告：

   • 用人单位在收到员工的书面辞职报告后，应确认其符合法律规定的提前通知期限（通常为提前三十日，试用期内提前三日），并妥善保存该报告作为离职流程的起始证据。

2. 办理离职手续：

   • 按照公司规定和劳动合同条款，与员工进行工作交接、财务结算等离职手续的办理。确保所有交接事项清晰明了，避免后续纠纷。

3. 解除劳动合同并出具证明：

   • 双方协商一致后，正式解除劳动合同。用人单位应出具解除劳动合同的证明，并在十五日内为员工办理档案和社会保险关系转移手续。

4. 保存劳动合同文本：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，用人单位对解除或终止的劳动合同文本至少保存二年备查。这有助于应对可能的劳动争议或劳动行政部门的检查。

5. 合规处理档案：

   • 保存期限过后，用人单位可根据内部档案管理规定，对劳动合同进行销毁或归档处理。但需确保销毁过程符合保密及档案管理的相关程序要求，保障信息安全。

劳动者方面

1. 提交书面辞职报告：

   • 员工应按规定提前向用人单位提交书面辞职报告，明确表达离职意愿，并给予用人单位足够的时间进行人员调整和工作安排。

2. 参与离职手续办理：

   • 积极配合用人单位办理离职手续，包括工作交接、财务结算等。确保所有交接事项顺利完成，避免给用人单位留下不必要的麻烦。

3. 妥善保管劳动合同副本：

   • 劳动合同是证明工作经历、社保缴纳起始时间、工资待遇等的重要凭证。即使辞职后，劳动者也应妥善保管好已解除的劳动合同副本，以备不时之需。

4. 确认离职手续办理情况：

   • 劳动者应确保用人单位已按规定出具解除劳动合同的证明，并且自己的档案和社保关系已正常办理转移。如发现用人单位未履行相关义务，应及时依法维权。

特殊情况下的处理建议

• 立刻辞职：若劳动者因用人单位存在过错（如未提供劳动保护、未及时支付劳动报酬等）或特殊约定、紧急情况（如职场暴力）而需要立刻辞职，应确保有充足证据支持，并及时与用人单位沟通协商。

• 经济补偿：若劳动者因用人单位存在违法行为而提出辞职，有权要求用人单位支付经济补偿金。具体补偿标准根据劳动者在本单位工作年限和月工资水平确定。

综合建议

员工辞职后劳动合同的处理不仅关乎双方的权益保护，也是遵守法律法规、维护劳动关系和谐稳定的重要环节。用人单位应依法依规处理劳动合同的解除和保存事宜，而劳动者也应积极参与离职过程并妥善保管个人劳动合同及相关证据材料。双方应共同协作，确保劳动合同的处置符合法律法规要求，为未来的可能争议提供有力的证据支持。