部门经理作为职工代表是否合法，需分情况讨论：
若部门经理符合职工代表条件且选举程序合法，则合法
- 条件符合：根据《企业民主管理规定》等相关法律法规，职工代表通常应由企业的一线职工、技术人员、管理人员等组成，代表职工的利益和意愿。部门经理作为企业管理人员之一，如果其同时具备职工身份（即与企业存在劳动关系，领取工资报酬），且符合职工代表的其他条件（如工作年限、岗位性质等，具体条件可能因企业规章制度而异），则其有资格被选为职工代表。
- 选举程序合法：职工代表的选举应遵循民主、公开、公正的原则，确保选举过程的合法性和有效性。如果部门经理是通过合法的选举程序被选为职工代表的，那么其身份就是合法的。
若部门经理不符合职工代表条件或选举程序不合法，则不合法
- 条件不符合：如果部门经理虽然是企业管理人员，但并不具备职工身份（如仅为企业高管，不直接参与企业日常生产经营活动，不领取工资报酬），或者不符合职工代表的其他条件，那么其就不应被选为职工代表。
- 选举程序不合法：如果职工代表的选举过程存在违法行为，如操纵选举、贿选等，那么选举结果就是无效的，部门经理作为职工代表的身份也就是不合法的。
法律建议：
- 对于企业而言，应制定明确的职工代表选举制度，明确职工代表的条件、选举程序等，确保选举的合法性和有效性。同时，应加强对职工代表的培训和管理，提高其代表职工利益的能力和水平。
- 对于职工而言，如果认为部门经理作为职工代表不合法，可以向企业工会或上级主管部门反映情况，要求重新选举或撤销其职工代表身份。如果问题得不到解决，还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
可能后果：
- 如果部门经理作为职工代表的身份不合法，那么其参与职工代表大会等民主管理活动的行为可能就是无效的，其代表职工发表的意见和提出的建议也可能不被采纳。
- 在极端情况下，如果部门经理利用职工代表的身份谋取私利或损害职工利益，还可能面临法律责任和纪律处分。
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