公司因员工迟到扣钱是否违规，需根据具体情况判断。以下从合法与违法两种情形进行详细分析：
合法情形
规章制度明确且合理：
- 企业有权制定内部规章制度，包括考勤制度和相应的奖惩措施。若规章制度中明确规定了迟到扣钱的条款，并且该规定经过了民主程序（如职工代表大会讨论通过）并公示告知员工，则企业依据此制度扣钱是合法的。
- 扣款金额应合理，通常不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。例如，若员工当月工资为5000元，则迟到扣款一般不得超过1000元，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。
劳动合同或集体合同有约定：
- 若企业与员工在劳动合同或集体合同中明确约定了迟到扣款的条款，且该约定不违反法律法规的强制性规定，则企业按照约定扣钱也是合法的。
违法情形
规章制度未公示或未经民主程序：
- 若企业的规章制度未向员工公示，或者虽然公示但未经过民主程序制定，则员工有权主张该制度无效，企业据此扣钱将构成违法。
扣款金额不合理：
- 如前所述，扣款金额应合理，不得超过法定限额。若企业随意设定高额罚款，甚至以罚款代替正常薪酬支付，将侵犯员工的合法权益。例如，若企业规定迟到一次扣款500元，且当月多次迟到累计扣款超过员工当月工资的20%，则该扣款规定可能违法。
无合法依据扣款：
- 若企业没有明确的规章制度或劳动合同约定作为扣款依据，仅凭管理者的个人意志或口头通知就进行扣款，将构成违法。
以罚代管：
- 企业不能仅依赖罚款来管理员工，而应通过培训、沟通等方式提升员工的纪律性和工作效率。若企业过度依赖罚款手段，可能被视为以罚代管，违反劳动法的基本原则。
法律建议：
- 对于员工而言，若认为公司扣款行为违法，可首先查阅公司规章制度和劳动合同，确认扣款是否有合法依据。若无合法依据或扣款金额不合理，可与公司协商解决；协商无果的，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 对于公司而言，应制定合法合理的规章制度，并经过民主程序制定和公示告知员工。同时，扣款金额应合理，不得超过法定限额，且应确保扣除后的剩余工资不低于当地月最低工资标准。
可能法律后果：
- 若公司扣款行为违法，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令改正、罚款等。同时，公司还可能需向员工支付被违法扣除的工资及相应的经济补偿。
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