公司因员工迟到扣钱是否违法，需根据具体情况判断。以下是详细分析：

1. 合法情形：

   • 规章制度明确且合理：企业有权制定内部规章制度，包括考勤制度和相应的奖惩措施。若规章制度中明确规定迟到扣钱的条款，并且该规定经过民主程序（如职工代表大会讨论通过）并公示告知员工，则企业依据此制度扣钱是合法的。扣款金额应合理，且不得超过劳动者当月工资的20%，扣除后的剩余工资也不得低于当地月最低工资标准。
   • 劳动合同或集体合同有约定：若企业与员工在劳动合同或集体合同中明确约定了迟到扣款的条款，且该约定不违反法律法规的强制性规定，则企业按照约定扣钱也是合法的。

2. 违法情形：

   • 规章制度未公示或未经民主程序：若企业的规章制度未向员工公示，或者虽然公示但未经过民主程序制定，则员工有权主张该制度无效，企业据此扣钱将构成违法。
   • 扣款金额不合理：若企业设定的罚款金额过高，超过了法定限额，或者以至于侵犯了员工的合法权益，那么这种扣款行为也是违法的。
   • 无合法依据扣款：若企业没有明确的规章制度或劳动合同约定作为扣款依据，仅凭管理者的个人意志或口头通知就进行扣款，这将构成违法。
   • 以罚代管：企业不能仅依赖罚款来管理员工，而应通过培训、沟通等方式提升员工的纪律性和工作效率。若企业过度依赖罚款手段，可能被视为以罚代管，这也违反了劳动法的基本原则。

综上所述，公司因员工迟到扣钱是否违法，关键在于扣款的依据、金额以及程序是否合法合理。如果您在这方面遇到了问题或争议，建议及时向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。