结论：办理了营业执照所建的附属建筑物是否算违建，不能一概而论，需根据建筑物的具体情况、当地规划要求以及相关法律法规进行综合判断。
分析说明：
违建的定义：
- 违建通常指的是未经规划、建设等部门批准，擅自搭建的建筑物或构筑物。这些建筑物可能违反了城市规划、土地管理等相关法律法规。
营业执照与违建的关系：
- 营业执照是商家合法经营的凭证，但它并不直接决定建筑物的合法性。即使办理了营业执照，如果所建的附属建筑物未经规划、建设等部门批准，仍然可能被视为违建。
判断违建的关键因素：
- 规划许可：建筑物是否取得了规划部门的许可，是判断其是否违建的关键。如果未经规划许可擅自搭建，即使办理了营业执照，也可能被认定为违建。
- 土地性质：建筑物的土地性质也是判断其合法性的重要因素。如果建筑物建在了不符合规划要求的土地上，如耕地、林地等，也可能被视为违建。
- 建筑安全：建筑物的安全性也是考虑的因素之一。如果建筑物存在安全隐患，如结构不稳、消防不达标等，也可能被要求拆除或整改。
不同情况下的处理：
- 如果建筑物合法：如果附属建筑物经过了规划、建设等部门的批准，且符合相关法律法规的要求，那么它就不是违建，可以合法存在和使用。
- 如果建筑物违建：如果附属建筑物未经批准擅自搭建，或者违反了相关法律法规的要求，那么它就是违建。在这种情况下，相关部门可能会要求拆除或整改，并可能对商家进行处罚。
法律建议：
- 核实规划许可：在搭建附属建筑物前，应先向当地规划部门咨询并办理相关手续，确保建筑物的合法性。
- 遵守土地管理法规：确保建筑物的土地性质符合规划要求，避免在耕地、林地等不符合规划要求的土地上搭建建筑物。
- 关注建筑安全：在搭建过程中，应确保建筑物的结构安全、消防达标等，避免存在安全隐患。
- 及时咨询专业律师：如果对建筑物的合法性存在疑问，或者已经面临违建拆除或整改的通知，应及时咨询专业律师，了解自己的权益和义务，并寻求合法的解决方案。
后续行动建议：
- 如果您已经搭建了附属建筑物，但不确定其是否合法，建议您尽快向当地规划部门咨询并办理相关手续。
- 如果您已经收到了违建拆除或整改的通知，建议您及时咨询专业律师，了解自己的权益和义务，并积极配合相关部门的工作，避免不必要的法律纠纷。
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