公司降低员工加班费是否违法，主要取决于降低后的加班费是否仍然不低于法律规定的标准，并且需遵循劳动合同的相关约定及法定程序。以下从不同角度为您详细分析：
一、从劳动合同角度
约定优先原则：
- 根据《劳动合同法》，劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确约定了加班费的计算基数、标准和支付方式，那么公司未经劳动者同意擅自降低加班费，就属于单方面变更劳动合同的重要条款，这违反了法律规定。
- 举例：若合同约定平时加班按工资的150%计算加班费，公司未经协商即降至120%，则明显违法。
协商一致变更原则：
- 用人单位与劳动者可以协商一致变更劳动合同内容，且变更应采用书面形式。因此，如果公司想要调整加班费，必须与劳动者充分沟通并签订书面协议，否则变更无效。
二、从法律规定角度
- 法定标准：
- 依据《中华人民共和国劳动法》第四十四条，加班费支付标准有明确规定：
- 平时延长工作时间，支付不低于工资的150%的工资报酬；
- 休息日工作且不能补休，支付不低于工资的200%的工资报酬；
- 法定休假日工作，支付不低于工资的300%的工资报酬。
- 如果公司降低加班费低于上述标准，则属违法行为，侵害了劳动者的合法权益。
三、特殊合法情形
民主程序与合理理由：
- 在经营困难等合理原因下，公司可以通过民主程序（如职工代表大会）与工会或职工代表协商确定调整加班费方案，并向劳动者说明情况。在此情况下的降低可能合法，但公司需提供充分证据证明其合理性和必要性。
集体合同变更：
- 如果存在集体合同，且按照法定程序对集体合同中关于加班费的约定进行了变更，且变更内容符合规定，则调整合法。
应对措施与建议
与公司沟通：
- 劳动者应首先与公司沟通，了解降低加班费的具体原因和依据，表达自己的诉求和关切。
收集证据：
- 保留加班记录、工资条等相关证据，以备后续维权使用。这些证据将有助于证明公司降低加班费的行为是否合法。
法律途径维权：
- 若公司拒绝按法律规定支付加班费，劳动者可向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，维护自身权益。在维权过程中，劳动者应保持冷静和理性，避免过激行为。
总结：公司降低加班费需谨慎行事，必须遵守法律规定和劳动合同约定。劳动者应了解自己的权益和义务，采取合适措施维护自身合法权益。在判断公司降低加班费是否合法时，应综合考虑降低后的加班费是否仍不低于法定标准以及是否遵循了相关程序和规定。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。