结论：离婚协议中约定“子女长大后自己选择跟谁”是可行的，但女方作为直接抚养方或潜在抚养方，仍需关注子女成长过程中的实际需求，并在必要时通过法律途径维护子女权益。以下从法律条款、实际操作、注意事项三个角度详细分析：

一、法律条款角度：子女意愿的尊重与限制

1. 法律基础
   根据《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条第三款规定：“离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。”
   这意味着，若子女已满八周岁，离婚协议中约定“子女长大后自己选择跟谁”符合法律规定，法院在后续争议中也会优先考虑子女意愿。

2. 法律限制
   需注意，子女意愿并非绝对。若一方存在家暴、虐待、遗弃、严重不良行为（如赌博、吸毒）或长期未履行抚养义务等情形，法院可能排除子女意愿，直接判决由另一方抚养。例如，若男方有吸毒史，即使子女表示愿意跟随男方，法院也可能因男方不利于子女成长而判决由女方抚养。

二、实际操作角度：女方的权利与义务

1. 直接抚养方的权利
   若子女未满八周岁，或虽已满八周岁但选择跟随女方，女方作为直接抚养方享有以下权利：

   • 要求男方支付抚养费（包括生活费、教育费、医疗费等），标准一般为男方月收入的20%-30%，具体可协商或由法院判决；
     
   • 在子女成年前，对子女重大事项（如升学、就医、出国等）享有决定权，但需与男方协商（除非男方长期失联或存在不利于子女的情形）；
     
   • 在男方未履行抚养义务时，可向法院申请强制执行抚养费。

2. 潜在抚养方的义务
   若子女选择跟随男方，女方仍需履行以下义务：

   • 支付抚养费（若法院判决或双方协商由女方支付）；
     
   • 定期探望子女（探望权是法定权利，男方不得无故阻挠）；
     
   • 关注子女成长，若发现男方存在不利于子女的行为（如家暴、虐待），可向法院申请变更抚养权。

三、注意事项角度：协议条款的完善与执行

1. 协议条款的明确性
   离婚协议中仅约定“子女长大后自己选择跟谁”可能过于笼统，建议补充以下内容：

   • 明确“长大后”的具体年龄（如满12周岁、16周岁或18周岁）；
     
   • 约定子女选择前的临时抚养安排（如由女方抚养至子女满12周岁，期间男方每月支付抚养费XX元）；
     
   • 约定子女选择后的抚养费调整方式（如若子女选择跟随男方，女方是否仍需支付抚养费，或男方需补偿女方前期抚养支出）。

2. 协议的执行与变更

   • 若一方未按协议履行义务（如拒付抚养费、阻挠探望），另一方可向法院起诉要求履行或变更协议；
     
   • 若子女意愿发生变化（如原本选择跟随女方，后因女方再婚、搬家等原因要求跟随男方），双方可协商变更抚养关系，协商不成可向法院起诉；
     
   • 法院在审理抚养权变更案件时，仍会以“最有利于未成年子女”为原则，而非单纯尊重子女意愿。

建议：女方在签订离婚协议时，可咨询专业律师，确保协议条款合法、明确且具有可操作性。若子女已满八周岁，可提前与子女沟通，了解其真实意愿，并在协议中体现。在子女成长过程中，女方应保持与子女的密切联系，关注其身心健康，为未来可能的抚养权争议做好准备。如有具体法律问题，可直接向我咨询。