结论：医疗期内晚提交病假条是否算旷工，不能一概而论，需结合具体情况判断，包括公司规章制度、晚提交的原因及证据等。
详细分析：
公司规章制度的影响：
- 首先，要查看公司的具体规章制度。有些公司可能明确规定，员工在医疗期内必须按时提交病假条，否则将视为旷工。如果公司有这样的规定，并且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么员工晚提交病假条确实可能构成旷工。
- 然而，如果公司的规章制度中并未明确规定晚提交病假条即视为旷工，或者规定存在模糊之处，那么就不能简单地认定员工晚提交病假条就是旷工。
晚提交的原因及证据：
- 员工晚提交病假条的原因也是判断是否构成旷工的重要因素。如果员工因突发疾病或紧急情况无法及时提交病假条，且事后能够提供合理的解释和证据（如医院出具的证明、紧急情况的相关证据等），那么公司通常不应将其视为旷工。
- 相反，如果员工无正当理由晚提交病假条，且无法提供合理解释和证据，那么公司有权根据规章制度或劳动合同的约定，将其视为旷工。
法律法规的考量：
- 在处理此类问题时，还需考虑相关法律法规的规定。例如，《劳动法》、《劳动合同法》等法律法规对员工的病假权益、旷工的认定及处理等都有明确规定。公司在制定规章制度时，必须遵守这些法律法规的强制性规定，否则规章制度可能无效。
- 如果公司因员工晚提交病假条而将其视为旷工，并据此进行处罚（如扣发工资、解除劳动合同等），员工有权依法维护自己的合法权益。
建议：
- 对于员工而言，在医疗期内应尽量按时提交病假条，以避免不必要的纠纷。如果因特殊情况无法及时提交，应及时与公司沟通并说明原因，同时保留好相关证据。
- 对于公司而言，应制定明确、合理的规章制度，并确保规章制度不违反法律法规的强制性规定。在处理员工晚提交病假条的问题时，应综合考虑多种因素，确保处理结果公平、合理。
后续行动：
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