针对员工在职期间飞单跳单给单位造成损失的情况，单位可以以“损害公司利益责任纠纷”或“劳动合同纠纷”为案由起诉员工。以下是对这两个案由的详细分析：

1. 损害公司利益责任纠纷：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司董事、监事、高级管理人员应当遵守法律、行政法规和公司章程，对公司负有忠实义务和勤勉义务。若员工（尤其是担任一定管理职务的员工）利用职务之便，通过飞单跳单等行为损害公司利益，公司可以依据此规定提起诉讼。
   • 适用情形：当员工的行为明显超出其职权范围，且直接损害了公司的经济利益时，如私自将公司业务转至其他公司或个人，导致公司失去交易机会或遭受经济损失，公司可以以“损害公司利益责任纠纷”为案由起诉员工。

2. 劳动合同纠纷：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者应当遵守劳动纪律和职业道德，忠实履行劳动合同约定的义务。若员工违反劳动合同中的保密义务、竞业限制义务或忠实义务，给用人单位造成损失的，用人单位有权要求员工承担赔偿责任。
   • 适用情形：当员工的行为违反了劳动合同中的相关条款，如保密协议、竞业限制协议或忠实义务条款，且给公司造成了经济损失时，公司可以以“劳动合同纠纷”为案由起诉员工。在此情况下，公司需要证明员工的行为与损失之间存在因果关系，以及损失的具体数额。

法律建议：

• 收集证据：在提起诉讼前，公司应充分收集员工飞单跳单的相关证据，包括但不限于交易记录、通讯记录、证人证言等，以证明员工的行为及给公司造成的损失。
• 评估损失：公司应对因员工行为造成的损失进行准确评估，包括直接损失和间接损失，以便在诉讼中提出合理的赔偿请求。
• 选择合适的案由：根据员工的具体行为及公司的损失情况，选择合适的案由提起诉讼。若员工行为明显超出职权范围且直接损害公司利益，可选择“损害公司利益责任纠纷”；若员工行为违反劳动合同条款，则可选择“劳动合同纠纷”。

可能的法律后果：

• 若法院认定员工行为构成损害公司利益或违反劳动合同，员工可能需要承担赔偿责任，赔偿公司因此遭受的损失。
• 在某些情况下，若员工行为构成犯罪（如职务侵占罪等），还可能面临刑事责任。

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