结论前置：事业单位领导以事业编员工不服从领导安排为由克扣绩效，这一行为是否违法，需结合具体情况来判断，但一般情况下，若克扣绩效缺乏合法依据或未遵循法定程序，则可能构成违法。以下从不同角度进行分析：
一、从劳动合同和规章制度的角度
劳动合同约定：
- 事业编员工的劳动合同中通常会明确约定工作内容、工作地点、劳动报酬等条款。如果劳动合同中并未规定不服从领导安排可以作为克扣绩效的依据，那么领导以此为由克扣绩效就缺乏合同依据，可能构成违法。
规章制度合法性：
- 事业单位的规章制度应当经过民主程序制定，并向员工公示或告知。如果规章制度中规定了不服从领导安排可以克扣绩效，但该规定本身违反了法律法规的强制性规定（如最低工资标准、劳动报酬支付等），或者制定程序不合法（如未经民主程序、未公示等），那么该规定也是无效的，领导不能以此为由克扣绩效。
二、从劳动法律法规的角度
劳动报酬支付：
- 根据《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。绩效作为劳动报酬的一部分，也应当按时足额支付。除非有法定或约定的情形，否则用人单位不得随意克扣。
违法克扣的后果：
- 如果领导以不服从领导安排为由克扣绩效，且该行为缺乏合法依据或未遵循法定程序，那么员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位支付被克扣的绩效，并可能要求用人单位支付赔偿金。
三、从实际操作和证据的角度
证据收集：
- 如果员工认为领导克扣绩效的行为违法，应当积极收集证据，如劳动合同、规章制度、工资条、考勤记录、工作记录等，以证明自己的主张。
协商与投诉：
- 在收集到足够证据后，员工可以先与领导或单位进行协商，要求支付被克扣的绩效。如果协商无果，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
四、特殊情况考虑
- 不服从安排的具体情形：
- 如果员工的不服从安排行为确实违反了单位的规章制度或劳动合同约定，且该行为对单位的正常运营造成了严重影响，那么单位在遵循法定程序的前提下，可能有权对员工进行一定的处罚，包括克扣部分绩效。但这种情况下的克扣也应当合理、适度，并符合法律法规的规定。
建议：如果你作为事业编员工遇到了领导以不服从安排为由克扣绩效的情况，建议你先仔细审查劳动合同和单位的规章制度，了解自己的权利和义务。同时，积极收集证据，与领导或单位进行协商。如果协商无果，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如果你对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。