结论：离职申请提交后经沟通不离职了，建议签署一份书面协议以明确双方的权利和义务，避免后续纠纷。以下从不同角度为你详细分析：

法律背景与风险分析

从法律角度来看，离职申请一旦提交，原则上即产生了法律效力，意味着你向用人单位表达了离职的意愿。虽然在实际操作中，很多情况下双方会通过沟通来变更这一意愿，但如果没有书面协议进行确认，就可能会存在法律风险。比如，用人单位可能基于你已提交的离职申请，开始安排工作交接、招聘新人等，如果你之后又反悔不离职，可能会给用人单位造成一定的损失，甚至可能引发劳动纠纷。

书面协议的重要性

1. 明确双方意愿：签署书面协议可以明确你和用人单位都不希望离职的共同意愿，避免因为口头沟通而产生的误解或争议。
2. 保障双方权益：协议中可以约定一些具体的条款，如你继续留任的职位、薪资、福利待遇等，以及用人单位对你的工作安排、考核标准等，从而保障双方的合法权益。
3. 作为证据使用：如果后续真的发生了纠纷，这份书面协议可以作为重要的证据，证明双方曾经就离职问题达成过一致意见，并且已经变更了原来的离职申请。

协议内容建议

在签署协议时，建议包含以下内容：

1. 双方基本信息：包括你和用人单位的名称、地址、联系方式等。
2. 协议背景：简要说明你曾经提交过离职申请，但经过沟通后双方决定不离职的情况。
3. 协议内容：明确你继续留任的职位、薪资、福利待遇等，以及用人单位对你的工作安排、考核标准等。
4. 协议期限：可以约定一个明确的期限，比如一年、两年等，也可以约定为无固定期限。
5. 违约责任：如果一方违反协议约定，需要承担什么样的违约责任，比如支付违约金、赔偿损失等。
6. 争议解决方式：约定如果发生纠纷，双方应该如何解决，比如通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式。

特殊情况处理

如果你和用人单位之间已经存在劳动合同，并且劳动合同中有关于离职的约定，那么在签署这份书面协议时，还需要注意与劳动合同的衔接和协调。如果协议内容与劳动合同有冲突或不一致的地方，建议以书面协议为准，但最好在协议中明确说明这一点，以避免后续纠纷。

最后建议：为了保障你的合法权益，避免后续纠纷，我建议你和用人单位签署一份书面协议来明确双方的权利和义务。如果你在签署协议过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。