结论：在不知情的情况下租了违建的门店，租金是否可以退还，需根据具体情况分析，但通常存在要求退还租金的可能性。以下从不同角度进行详细分析：
一、法律角度
合同效力问题：
- 根据《民法典》的相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的合同无效。违建门店因未取得合法建设手续，其租赁合同可能因违反法律强制性规定而被认定为无效。
- 若合同无效，因该合同取得的财产，应当予以返还。因此，在合同无效的情况下，您有权要求出租方退还已支付的租金。
出租方过错：
- 出租方作为违建门店的所有者或管理者，明知或应知该门店为违建仍进行出租，存在明显过错。
- 根据过错原则，出租方应承担因其过错导致的合同无效及租金退还等法律责任。
二、实际操作角度
收集证据：
- 在要求退还租金前，您需要收集相关证据证明自己是在不知情的情况下租赁了违建门店，如租赁合同、支付租金的凭证、与出租方的沟通记录等。
- 同时，您还需要证明该门店确实为违建，如相关部门的查处通知、违建认定文件等。
与出租方协商：
- 在收集到足够证据后，您可以先与出租方进行协商，要求其退还租金并承担相应责任。
- 协商过程中，您可以明确告知出租方其违建行为及合同无效的法律后果，以促使其积极配合解决问题。
法律途径：
- 若协商无果，您可以考虑通过法律途径解决纠纷，如向法院提起诉讼或申请仲裁。
- 在诉讼或仲裁过程中，您需要提交相关证据证明自己的主张，并请求法院或仲裁机构判决出租方退还租金及承担相应法律责任。
三、特殊情况考虑
承租方过错：
- 如果在租赁过程中，您明知或应知该门店为违建仍进行租赁，或者在使用过程中存在过错导致合同无法继续履行，那么您可能无法要求全额退还租金。
- 在此情况下，法院或仲裁机构可能会根据双方过错程度进行责任划分，并判决出租方退还部分租金或不予退还。
合同约定：
- 如果租赁合同中明确约定了违建情况下的租金退还条款，那么双方应按照合同约定执行。
- 若合同未约定或约定不明确，则需根据法律规定及实际情况进行判断和处理。
建议：在处理此类纠纷时，建议您先与出租方进行友好协商，尽量通过协商解决问题。若协商无果，再考虑通过法律途径维护自己的合法权益。同时，在租赁门店前，您也应尽到合理的审查义务，了解门店的合法性及产权情况，以避免类似纠纷的发生。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。