结论前置：在股权代持关系中，若代持人和公司不配合实际出资股东变为工商登记显名股东，诉讼主体通常包括实际出资股东（原告）、股权代持人（被告），公司可能作为第三人参与诉讼。以下是对此问题的详细分析：
一、诉讼主体的确定
实际出资股东（原告）：
- 实际出资股东是希望成为工商登记显名股东的一方，他们因代持人和公司的不配合而无法直接实现这一目的，因此有权提起诉讼。
- 实际出资股东需要证明其与股权代持人之间存在有效的股权代持协议，并且已经履行了出资义务。
股权代持人（被告）：
- 股权代持人是名义上的股东，他们在工商登记上显示为股东，但实际上并不享有股东权益（除非代持协议另有约定）。
- 在实际出资股东要求成为显名股东的诉讼中，股权代持人作为被告，需要承担证明其与实际出资股东之间代持关系不存在或已解除的举证责任（如果其主张如此）。
公司（第三人）：
- 公司虽然不是股权代持协议的直接当事人，但股权的变更涉及到公司的股东名册和工商登记的变更，因此公司可能作为第三人参与诉讼。
- 公司需要提供相关的股东名册、公司章程等文件，以证明股权的当前状态，并协助法院进行股权变更的登记手续。
二、诉讼的法律依据
- 《中华人民共和国公司法》及相关司法解释：这些法规规定了股东资格的确认、股权转让等事项，为实际出资股东要求成为显名股东提供了法律依据。
- 股权代持协议：这是实际出资股东和股权代持人之间的重要法律文件，它规定了双方的权利和义务，包括股权的代持、出资、收益分配以及股权变更等事项。
三、诉讼流程与注意事项
准备证据：
- 实际出资股东需要准备股权代持协议、出资证明、公司股东名册、公司章程等证据，以证明其与股权代持人之间的代持关系以及已经履行出资义务。
提起诉讼：
- 实际出资股东应向有管辖权的人民法院提起诉讼，明确诉讼请求（如要求确认股东资格、变更工商登记等），并提交相关证据。
参与诉讼：
- 在诉讼过程中，实际出资股东、股权代持人和公司应积极参与，提交证据、进行辩论，并遵守法庭秩序。
执行判决：
- 如果法院判决支持实际出资股东的诉讼请求，股权代持人和公司应配合办理股权变更的工商登记手续。如果拒不配合，实际出资股东可以申请法院强制执行。
四、可能面临的法律后果
- 如果实际出资股东胜诉：股权代持人和公司需要配合办理股权变更的工商登记手续，实际出资股东将成为工商登记的显名股东。
- 如果股权代持人胜诉：则实际出资股东无法成为显名股东，其股东权益可能继续通过股权代持协议来保障（如果协议有效且未解除）。
- 如果公司拒不配合：公司可能面临法院的强制执行措施，如罚款、拘留等，同时其信誉和形象也可能受到损害。
建议：在实际操作中，建议实际出资股东在提起诉讼前尽量与股权代持人和公司进行协商，以寻求和解或达成其他解决方案。如果协商无果，再考虑通过法律途径解决。同时，在签订股权代持协议时，应明确约定股权变更的条件和程序，以减少后续纠纷的发生。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。