公司保管员工手机是否合法，需根据具体情况来判断，但总体来说，在符合法律法规和合理管理要求的前提下，公司保管员工手机是合法的。以下从多个角度进行分析：
一、合法性基础
企业自主管理权：
- 企业有权制定内部规章制度，以维护正常的生产经营秩序。若规章制度明确规定上班期间需将手机统一保管，且该规定不违反法律法规的强制性规定，不侵犯员工的基本权益，则企业有权执行此规定。例如，在生产制造企业，为防止手机干扰精密设备或分散员工注意力引发安全事故，此规定是合理且必要的。
法律法规依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动纪律等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。只有依法制定的规章制度中关于手机存放的规定才具有法律效力。
二、合法性条件
规章制度合法：
- 公司的规章制度必须合法合规，不得与法律法规相抵触。同时，规章制度应明确手机保管的具体规定，如保管时间、保管方式、保管责任等，并确保这些规定不侵犯员工的合法权益。
履行告知义务：
- 用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度公示，或者告知劳动者。公司应在实施手机保管规定前，通过适当方式（如员工手册、培训会议等）明确告知员工该规定的具体内容和目的，以保障员工的知情权。
不侵犯员工基本权利：
- 公司保管手机的规定不得过度限制员工在工作期间合理使用手机的权利。例如，当员工有紧急事务需要及时联系外界时，公司应提供合理的解决方案，如允许员工在特定情况下使用手机或提供紧急联系方式。
三、可能不合法的情况
侵犯员工隐私权：
- 若公司在保管手机过程中未经员工同意擅自查看手机内容，涉嫌侵犯员工的隐私权和个人信息权益，这是明显违法的。公司必须确保员工的隐私得到严格保护，保管人员不得随意接听或翻看员工手机。
规章制度非法：
- 如果公司的规章制度未按照法律规定的程序制定或公布，那么其中的手机保管规定将无效。公司据此要求员工保管手机的行为也可能被视为不合法。
四、特殊情况与建议
特殊行业或岗位：
- 对于涉及国家安全、保密等特殊行业或岗位，如军工企业、科研单位等，上班时间手机统一保管可能是必要的，以确保国家安全和信息安全。但即便如此，公司也应明确告知员工相关规定，并确保管理措施的合法性和合理性。
员工权益保护：
- 如果员工认为公司保管手机的规定侵犯了自己的合法权益，应先与公司进行沟通协商，尝试寻求合理的解决方案。协商不成时，员工可以向劳动监察部门投诉或通过劳动仲裁等法律途径维护自身权益。
总结来说，公司保管员工手机在符合法律法规和合理管理要求的前提下是合法的。但公司应确保规章制度的合法性、履行告知义务、不侵犯员工基本权利，并特别注意保护员工的隐私权。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。