核心结论：在合同期内遇到工资算法不统一的情况，您可以通过以下步骤维护自身权益：1. 核查合同条款；2. 收集证据；3. 与用人单位协商；4. 向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。以下为详细说明：

1. 核查合同条款

首先，您需要仔细审查劳动合同中关于工资计算方式的条款。如果合同中明确约定了工资的计算方法（如基本工资、绩效工资、奖金等构成及计算标准），而用人单位实际执行的算法与合同约定不符，则用人单位的行为可能构成违约。此时，您可以依据合同条款要求用人单位按照约定支付工资。

法律依据：
根据《中华人民共和国劳动合同法》第十七条，劳动合同应当明确约定劳动报酬条款。若用人单位未按照合同约定支付工资，劳动者有权要求其支付差额部分。

2. 收集证据

如果合同条款不明确或用人单位以“公司制度”“口头通知”等方式变更工资算法，您需要收集以下证据以支持您的主张：

• 工资条、银行流水：证明实际发放的工资金额与合同约定或过往发放记录不符；
  
• 劳动合同、员工手册：证明工资算法的原始约定或公司制度内容；
  
• 沟通记录：如邮件、微信、录音等，证明您曾就工资算法问题与用人单位交涉；
  
• 同事证言：若有其他同事遇到类似情况，可联合提供证言（需注意证人出庭作证的可能性）。

法律依据：
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第六条，发生劳动争议时，当事人需对自己的主张提供证据。用人单位掌握工资支付记录的，应由其承担举证责任。

3. 与用人单位协商

在证据充分的情况下，您可以先与用人单位的人力资源部门或直接上级沟通，明确指出工资算法不统一的问题，并要求其按照合同或法律规定补发工资。协商时建议以书面形式（如邮件）留存记录，避免口头沟通无凭证。

提示：
若用人单位以“经营困难”“制度调整”等理由拒绝补发，您可要求其出具书面说明，并明确告知其行为的法律后果。

4. 向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁

如果协商无果，您可以通过以下途径维权：

• 向劳动监察部门投诉：向用人单位所在地的劳动保障监察大队提交书面投诉材料，要求其责令用人单位限期支付工资差额；
  
• 申请劳动仲裁：向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，主张工资差额及可能的经济补偿（如用人单位恶意拖欠工资，您可依据《劳动合同法》第三十八条解除合同并主张经济补偿）。

法律依据：
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或无故拖欠。若用人单位违反，劳动者可依法维权。

补充建议

• 时效性：劳动争议申请仲裁的时效为一年，自您知道或应当知道权益被侵害之日起计算，建议尽快行动；
  
• 专业支持：若案件复杂（如涉及绩效工资、奖金计算等），可整理证据后直接向我咨询，我将协助您分析案情并制定维权策略。

希望以上解答对您有所帮助。如有进一步问题，欢迎随时提问。