自离工资扣款是否合法，主要取决于劳动者的自离行为是否给用人单位造成了实际损失，并且用人单位在扣除工资时是否符合法定程序和限额规定。以下是对这一问题的详细分析：

1. 合法扣工资的情况：

   • 造成实际损失：如果员工的自离行为确实给用人单位造成了实际损失，如因未完成工作交接导致业务中断、数据丢失等，用人单位有权要求员工赔偿。这种赔偿应通过合法合理的方式进行，如按照双方事先的约定或依据实际损失情况来确定赔偿金额。在扣除赔偿金时，用人单位需遵守以下规定：
     • 每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。
     • 若扣除后的剩余工资低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。
   • 未提前通知解除劳动合同：如果劳动合同或公司规章制度明确规定，劳动者辞职需提前一定期限（如30天）书面通知用人单位，否则将承担相应责任（如扣发工资作为违约金）。在这种情况下，如果劳动者未履行提前通知义务而擅自离职，用人单位有权根据规定扣除部分工资。但需注意，这种扣除必须基于合法的规章制度和明确的合同约定。

2. 不合法扣工资的情况：

   • 无法律依据的扣款：用人单位不能仅凭“自离”这一行为就随意扣除劳动者的全部或部分工资。除非有明确的法律规定或合同约定，否则用人单位无权单方面决定扣除劳动者的工资。
   • 违反法定程序的扣款：即使劳动者存在过错，用人单位在扣除工资时也必须遵循法定程序。例如，应事先告知劳动者扣款的原因、依据和金额，并听取劳动者的意见和申辩。未经法定程序，用人单位不得擅自扣除劳动者的工资。

3. 维权途径：

   • 如果用人单位无故克扣工资，劳动者可以通过以下途径来维护自身权益：
     • 协商：首先尝试与用人单位进行协商，要求足额支付工资。
     • 投诉：若协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令用人单位改正。
     • 仲裁与诉讼：如果投诉仍未解决问题，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求对仲裁结果不服的，还可以向人民法院提起诉讼。

4. 其他注意事项：

   • 无论员工是否自离，公司都应支付员工已提供劳动部分的工资。即如果员工在离职前已经为公司工作了一段时间，公司应该按照员工实际出勤的天数支付工资。

法律依据：

• 《中华人民共和国劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
• 《工资支付暂行规定》第十六条：因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
• 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条：用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。

综上所述，自离扣工资并非一概而论地合法或不合法，而是需要根据具体情况来判断。劳动者和用人单位在处理此类问题时，都应遵循法律法规，确保双方权益得到妥善保护。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。