结论：不按公司规定时间抽烟是否算严重违纪，需结合公司具体规章制度、该制度制定的合法性及合理性，以及抽烟行为对公司造成的实际影响等多方面因素综合判断。以下从不同角度为你详细分析：

1. 公司规章制度的合法性与合理性

   • 合法性：公司有权制定内部规章制度来管理员工，但这些制度必须符合国家法律法规的规定，不能侵犯员工的合法权益。如果公司规章制度中明确规定了抽烟的时间、地点等，并且该规定经过了合法的制定程序（如经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，并进行了公示或告知员工），那么该规定在公司内部管理上具有一定的效力。
   • 合理性：除了合法性外，公司规章制度还需要具有合理性。例如，如果公司规定员工在任何时间、任何地点都不能抽烟，这可能过于严苛，缺乏合理性。但如果公司规定在特定的工作区域或时间段内禁止抽烟，以维护工作环境和员工健康，这样的规定则相对合理。

2. 抽烟行为是否构成严重违纪

   • 轻微违纪：如果员工只是偶尔不按公司规定时间抽烟，且没有造成其他不良影响，那么这种行为可能只构成轻微违纪。公司可以采取警告、口头提醒等方式进行纠正，而不必直接认定为严重违纪。
   • 严重违纪：如果员工多次不按公司规定时间抽烟，或者抽烟行为对公司造成了较大的负面影响（如引发火灾、影响其他员工工作等），那么这种行为可能构成严重违纪。公司有权根据规章制度对员工进行相应的处罚，包括但不限于警告、记过、降职、解雇等。

3. 员工权益保护与应对措施

   • 了解规章制度：员工在入职时，应仔细阅读公司的规章制度，了解其中关于抽烟等行为的规定。如果认为某些规定不合理或侵犯了自己的合法权益，可以及时向公司提出异议或寻求法律帮助。
   • 沟通协商：如果员工因不按公司规定时间抽烟而受到处罚，但认为处罚过重或不合理，可以与公司进行沟通协商，寻求合理的解决方案。
   • 法律途径：如果沟通协商无果，员工可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。在维权过程中，员工需要提供充分的证据来证明自己的主张，如公司规章制度、处罚决定书、沟通记录等。

建议：作为员工，应自觉遵守公司的规章制度，包括关于抽烟等行为的规定。如果认为某些规定不合理或侵犯了自己的合法权益，可以通过合法途径提出异议或寻求法律帮助。同时，公司也应制定合理、合法的规章制度，并加强对员工的培训和教育，共同营造一个良好的工作环境。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。