关于公司规章制度中是否可以写入罚款条款及其合法性的问题，这是一个涉及劳动法律法规和企业管理制度的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：

一、罚款条款的合法性基础

首先，需要明确的是，罚款作为行政处罚的一种形式，其行使主体具有法定性。在我国，只有行政机关或法律授权的机构才有权对违法行为进行罚款。企业作为民事主体，并不具备这样的权力。因此，公司规章制度中直接规定的罚款条款，很可能因缺乏法律依据而被认定为无效。

二、特定情况下的经济损失赔偿

尽管企业不能直接对员工进行罚款，但在特定情况下，如员工因故意或重大过失给企业造成经济损失时，企业可以依据相关法律法规要求员工进行赔偿。这种赔偿并非罚款，而是基于员工过错导致的实际经济损失的补偿。根据《工资支付暂行规定》，企业可以从员工本人的工资中扣除赔偿部分，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。

三、规章制度制定的合法性原则

企业在制定规章制度时，必须遵循以下合法性原则：

1. 合法性：规章制度的内容必须符合国家法律、行政法规及政策规定，不得侵犯员工的合法权益。
2. 合理性：规章制度应当公平、合理，避免过于苛刻或不合理的要求，以确保员工能够接受并遵守。
3. 民主性：规章制度的制定应当经过民主程序，如职工代表大会讨论通过，以确保员工的参与和意见表达。
4. 公示性：规章制度应当向全体员工公示，确保员工了解并知晓相关规定。

四、替代措施与建议

鉴于罚款条款的合法性风险，企业可以考虑采取以下替代措施来维护管理秩序和员工权益：

1. 设定绩效奖金考核制度：通过设定明确的绩效考核标准和奖金制度，激励员工积极工作，提高工作效率和质量。
2. 采取警告、记过等处分措施：对于员工的违规行为，企业可以采取警告、记过、降职等处分措施来纠正和管理，但这些措施也需符合法律法规的规定和企业的实际情况。
3. 加强员工培训和教育：通过加强员工培训和教育，提高员工的法律意识和职业素养，减少违规行为的发生。

五、结论与建议

综上所述，公司规章制度中不可以直接规定罚款作为对员工的处罚措施。企业应当遵循法律法规的规定，采取合法、合理、民主的管理方式。在制定规章制度时，应优先确保条款的合法性，避免将罚款作为常规管理工具。同时，企业可以通过正向激励和合理的处分措施来维护管理秩序和员工权益。必要时，建议咨询专业律师进行合法性审查，以确保规章制度的合规性和有效性。