员工部分工资由老板个人卡支付，确实存在多方面的风险，具体如下：

1. 税务风险：

   • 个人所得税问题：根据税法规定，工资薪金所得应由支付单位代扣代缴个人所得税。如果老板通过个人卡支付部分工资，这部分工资可能未被纳入个税申报系统，导致员工个人所得税申报不完整，进而可能面临税务机关的核查和处罚。
   • 企业所得税问题：对于企业而言，如果工资支出未通过正规渠道（如公司账户）支付，可能无法在企业所得税前扣除，从而增加企业的税务负担。

2. 劳动法律风险：

   • 工资支付记录不完整：正规的工资支付应通过公司账户进行，并留下完整的支付记录。如果部分工资通过个人卡支付，可能导致工资支付记录不完整，一旦发生劳动纠纷，员工可能难以证明自己的实际工资水平，而企业也可能面临举证不能的风险。
   • 违反最低工资标准：如果通过个人卡支付的工资部分未计入员工的实际工资总额，可能导致员工的实际工资低于当地最低工资标准，从而违反劳动法律法规，企业可能面临劳动监察部门的处罚。

3. 财务管理风险：

   • 资金流转不透明：通过个人卡支付工资可能导致公司资金流转不透明，难以进行有效的财务管理和监控。这可能影响公司的财务决策和资金安全。
   • 难以审计和核查：在审计或核查过程中，如果发现部分工资通过个人卡支付，可能引发审计人员对公司财务合规性的质疑，进而增加公司的审计成本和风险。

4. 法律责任风险：

   • 老板个人可能承担法律责任：如果老板通过个人卡支付工资的行为被认定为逃避税务或劳动法律监管，老板个人可能面临法律责任，包括罚款、滞纳金甚至刑事责任。
   • 企业可能面临连带责任：虽然工资是通过个人卡支付的，但如果这一行为被认定为企业的行为或企业默许的行为，企业也可能面临连带责任，包括赔偿员工损失、接受行政处罚等。

建议：

• 企业应规范工资支付流程：确保所有工资支出都通过公司账户进行，并留下完整的支付记录。这有助于维护企业的财务合规性，降低税务和劳动法律风险。
• 加强财务管理和监控：企业应建立完善的财务管理制度，加强对资金流转的监控和管理。这有助于及时发现和纠正不规范的支付行为，保障企业的资金安全。
• 增强法律意识：企业和老板都应增强法律意识，了解并遵守相关的税务和劳动法律法规。这有助于避免不必要的法律风险，维护企业的合法权益。

如果员工发现自己的工资部分由老板个人卡支付，或者企业存在其他不规范的支付行为，应及时向企业提出异议，并保留相关证据以备不时之需。同时，也可以直接向我咨询相关法律问题，我会为你提供专业的法律建议和帮助。