结论：员工能否拒绝公司将其搬迁到子公司办公，需根据具体情况判断，主要取决于劳动合同中的相关约定以及搬迁是否对员工造成实质性不利影响。
分析如下：
劳动合同约定：
- 如果劳动合同中明确约定了工作地点为总公司，且未提及子公司或类似变更情况，那么公司单方面将员工搬迁到子公司办公，可能构成对劳动合同的变更。根据《劳动合同法》的相关规定，变更劳动合同应当与劳动者协商一致，并采用书面形式。因此，在这种情况下，员工有权拒绝搬迁，并可以要求公司继续履行原劳动合同。
实质性不利影响：
- 即使劳动合同中没有明确约定工作地点仅为总公司，但如果搬迁到子公司对员工造成了实质性不利影响（如通勤时间大幅增加、工作环境显著恶化、薪酬待遇降低等），员工同样有权拒绝搬迁。在这种情况下，员工可以与公司进行协商，要求公司采取相应的补偿措施或调整工作安排。如果协商无果，员工还可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益。
公司合理调整：
- 如果公司能够证明搬迁到子公司是出于生产经营需要，且对员工没有造成实质性不利影响，或者公司已经采取了合理的补偿措施（如提供交通补贴、调整工作时间等），那么员工可能需要接受公司的调整安排。然而，这并不意味着员工完全无权拒绝，如果员工认为公司的调整仍然不合理或对自己造成了不公平的影响，仍然可以通过法律途径进行维权。
建议：
- 审查劳动合同：员工应首先审查自己的劳动合同，了解其中关于工作地点的约定以及变更劳动合同的相关条款。
- 与公司协商：如果员工对搬迁有异议，应与公司进行积极沟通，表达自己的诉求和关切，并尝试通过协商解决问题。
- 寻求法律援助：如果协商无果，员工可以咨询专业律师（如我，储英芳律师，专注于医疗事故赔偿、工伤赔偿领域，但同样具备处理劳动工伤问题的能力），了解自己的法律权益和可能的维权途径。在必要时，员工还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
可能后果：
- 如果员工拒绝搬迁且公司无法证明搬迁的合理性或未采取合理补偿措施，公司可能面临违法变更劳动合同的法律风险，需要承担相应的法律责任。
- 如果员工接受搬迁但后续发现公司存在违法行为或对自己造成了不公平的影响，员工仍然有权通过法律途径进行维权。