当承包人（施工方）原因导致工程不合格时，其赔偿责任及方式需依据合同约定、相关法律法规及实际情况进行综合判定。以下是对此问题的详细解答：

一、民事责任

1. 继续履行与修复责任

   • 承包人有义务对质量不合格的工程进行返工、修理，直至达到合同约定的质量标准。这是基于《中华人民共和国民法典》的相关规定，即当事人一方不履行或履行合同义务不符合约定时，应承担继续履行等违约责任。例如，若墙面平整度不达标，承包人需重新抹灰至合格。
   • 若经过修理或返工后，工程仍逾期交付，承包人还需承担因此产生的违约责任。

2. 赔偿损失责任

   • 直接损失：承包人需赔偿因工程质量问题导致的直接经济损失，这包括但不限于修复费用、拆除不合格工程的费用、因工程不合格导致的额外建设成本等。
   • 间接损失：在证明损失与工程质量问题存在因果关系且为可预见的情况下，承包人也需赔偿间接损失。例如，因工程延期导致的经营利润损失、对第三方承担的违约责任等。间接损失的赔偿需满足因果关系及可预见性条件。

3. 减少价款责任

   • 若工程质量虽不合格但经修复可使用，且建设单位同意接收，建设单位有权要求合理减少工程价款。

4. 合同约定责任

   • 双方在施工合同中明确约定的工程质量不合格时的具体责任，如违约金、损失赔偿额等，承包人也需按约承担。

二、不同情形的赔偿责任

1. 修复后经验收合格

   • 承包人应承担修复费用，包括材料费、人工费等。即使合同无效且初验不合格，经修复后验收合格的，发包人仍有权要求承包人承担修复费用。

2. 修复后经验收仍不合格

   • 承包人无权请求工程价款，并需对发包人因工程不合格遭受的损失承担赔偿责任。这包括但不限于租赁替代场地的费用、生产延误损失等，且责任分配需考虑双方过错程度。

3. 未经验收擅自使用

   • 若发包人未经竣工验收擅自使用工程，并以质量不符合约定为由主张权利，通常不予支持。但承包人仍需对地基基础工程和主体结构质量在合理使用寿命内承担责任。

三、行政责任与刑事责任

1. 行政责任

   • 根据《建设工程质量管理条例》，承包人因偷工减料、使用不合格材料或不按设计图纸施工等行为导致工程质量不合格的，可被处以工程合同价款百分之二至百分之四的罚款。
   • 情节严重时，建设行政主管部门可降低承包人的资质等级甚至吊销其资质证书，限制其承接工程范围或剥夺其施工资格。
   • 建设行政主管部门还可责令承包人停业整顿，要求其全面排查和整改工程质量问题，待验收合格后方可恢复施工。

2. 刑事责任

   • 若因施工质量不合格造成重大安全事故，构成犯罪的，相关责任人员需承担刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，违反国家规定降低工程质量标准，造成重大安全事故的，可直接责任人员处五年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；后果特别严重的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。

四、综合考量因素与建议

在确定赔偿金额时，还需综合考虑不合格的程度、对工程整体使用功能的影响、对人身或财产安全的威胁等因素。这些因素将直接影响最终的赔偿结果。

建议：面对建设工程质量不合格的情况，建议首先查阅合同条款，明确双方的权利与义务。同时，咨询专业律师或相关机构，以制定符合法律法规且兼顾双方利益的赔偿方案。此外，承包人应严格遵守施工规范和合同约定，确保工程质量符合标准，以避免不必要的法律责任和经济损失。建设单位也应加强监管，及时发现并处理工程质量问题，维护自身合法权益。