扣公司的章是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 合法扣章的情况：

   • 公司内部管理需要：如果扣章行为是基于公司内部管理的合理需要，比如为了防止公章被滥用或丢失，而采取的临时保管措施，且这种行为得到了公司合法授权或符合公司章程、内部管理制度的规定，那么这种扣章行为通常是合法的。
   • 法律程序要求：在某些法律程序中，如诉讼、仲裁等，为了保全证据或履行法律义务，可能需要暂时扣留公司公章。这种情况下，扣章行为是依据法律程序进行的，也是合法的。

2. 违法扣章的情况：

   • 未经授权擅自扣章：如果扣章行为没有得到公司的合法授权，或者违反了公司章程、内部管理制度的规定，那么这种行为就是违法的。例如，个人为了私利或出于其他非法目的，擅自扣留公司公章，就可能构成违法行为。
   • 侵犯公司财产权：公司公章是公司的重要财产，未经允许擅自扣留或使用，可能构成对公司财产权的侵犯。根据《中华人民共和国公司法》等相关法律法规，公司有权保护其财产不受非法侵害。
   • 可能构成犯罪：在极端情况下，如果扣章行为伴随着其他违法行为，如诈骗、盗窃等，那么这种行为可能构成犯罪，需要承担刑事责任。

法律建议：

• 明确授权与程序：如果因公司内部管理需要扣留公章，应确保有明确的授权和合法的程序，避免个人擅自决定。
• 遵守法律法规：在任何情况下，都应遵守相关法律法规和公司章程的规定，不得擅自扣留或使用公司公章。
• 及时咨询与处理：如果发现有人擅自扣留公司公章或存在其他违法行为，应及时向公司管理层报告，并考虑咨询专业律师的意见，以便及时采取措施维护公司权益。

可能后果：

• 如果扣章行为违法，可能面临公司内部的纪律处分，如警告、罚款、解雇等。
• 如果扣章行为构成对公司财产权的侵犯或其他违法行为，可能面临民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。

总之，扣公司的章是否违法取决于具体情境和法律规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。