农民工在工作中遇车祸死亡，单位应当承担的责任主要包括工伤赔偿责任，并可能涉及其他民事赔偿责任，具体分析如下：
一、工伤赔偿责任
工伤认定：
- 根据《工伤保险条例》的相关规定，农民工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的，应当认定为工伤。在此案例中，农民工在工作中遇车祸死亡，显然符合工伤认定的条件。
赔偿项目：
- 丧葬补助金：按照统筹地区上年度职工月平均工资的6个月计发。
- 供养亲属抚恤金：按照职工本人工资的一定比例发给由因工死亡职工生前提供主要生活来源、无劳动能力的亲属。标准为：配偶每月40%，其他亲属每人每月30%，孤寡老人或者孤儿每人每月在上述标准的基础上增加10%。核定的各供养亲属的抚恤金之和不应高于因工死亡职工生前的工资。
- 一次性工亡补助金：标准为上一年度全国城镇居民人均可支配收入的20倍。这一标准会根据国家统计局发布的最新数据进行调整。
赔偿程序：
- 单位应当在事故发生之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。如果单位未按时提出申请，工伤职工或者其近亲属、工会组织可以在事故伤害发生之日起1年内，直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
- 工伤认定后，单位需要按照工伤保险条例的规定，支付相应的工伤赔偿费用。如果单位未依法缴纳工伤保险费，发生工伤事故的，由单位支付工伤保险待遇。
二、其他民事赔偿责任
交通事故责任：
- 如果车祸是由第三方（如其他车辆驾驶员）造成的，那么农民工的家属还可以向第三方主张民事赔偿责任。这包括但不限于医疗费、丧葬费、死亡赔偿金、被扶养人生活费等。
单位过错责任：
- 如果单位在安全管理、工作安排等方面存在过错，导致农民工发生车祸死亡，那么单位还可能需要承担相应的民事赔偿责任。这需要根据具体情况进行判断，如单位是否提供了安全的工作环境、是否进行了必要的安全培训等。
三、实际操作建议
及时报案与申请工伤认定：
- 农民工家属在得知事故后，应尽快向单位报告，并要求单位及时向社会保险行政部门提出工伤认定申请。同时，也可以自行向社会保险行政部门提出申请。
收集证据：
- 农民工家属应收集与事故相关的证据，如现场照片、证人证言、医疗记录等，以便在后续的工伤认定和赔偿程序中使用。
咨询专业律师：
- 在处理此类复杂案件时，建议农民工家属咨询专业律师，以获取更详细的法律建议和帮助。不过，在这里你可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供针对性的法律意见。
总结来说，农民工在工作中遇车祸死亡，单位应当承担工伤赔偿责任，并可能涉及其他民事赔偿责任。农民工家属应及时报案、申请工伤认定，并收集相关证据，以便在后续的赔偿程序中使用。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。