结论：在对方已经做了司法鉴定的情况下，您通常不能仅按照医嘱来处理，而应尊重司法鉴定的结果。不过，具体是否可以按医嘱走，还需根据司法鉴定的内容、目的以及医嘱与司法鉴定之间的关联性来综合判断。
分析说明：
司法鉴定的权威性：
- 司法鉴定是由专业的鉴定机构或鉴定人，依据科学、客观、公正的原则，对案件中的专门性问题进行鉴定并出具鉴定意见的活动。在医疗纠纷中，司法鉴定通常用于确定医疗行为是否存在过错、过错与损害后果之间的因果关系以及过错参与度等关键问题。
- 司法鉴定的结果具有较高的权威性和证明力，是法院审理案件时的重要参考依据。
医嘱与司法鉴定的关系：
- 医嘱是医生根据患者的病情和医疗需要，对患者作出的治疗、护理等方面的指示。它主要反映了医生对患者当前病情的判断和治疗建议。
- 司法鉴定则是对医疗行为及其后果的全面、客观、科学的评估。它可能涉及医嘱的合理性、执行情况以及与损害后果的关联性等多个方面。
- 在某些情况下，医嘱可能是司法鉴定的重要参考依据之一，但司法鉴定并不仅仅局限于医嘱的内容。
是否可以按医嘱走的判断：
- 如果司法鉴定已经全面、客观地评估了医疗行为及其后果，并且鉴定意见与医嘱内容相符或医嘱内容对鉴定意见无实质性影响，那么按照司法鉴定结果处理是合理的。
- 如果医嘱内容与司法鉴定结果存在显著差异，或者医嘱内容对鉴定意见有实质性影响（例如，医嘱中的治疗建议未得到执行，且该未执行与损害后果有直接关联），那么仅按照医嘱处理可能无法全面、准确地反映医疗行为的真实情况及其后果。
特殊场景：
- 在某些特殊情况下，如果医嘱内容对于确定医疗行为过错或损害后果具有关键作用，且司法鉴定未充分考虑医嘱内容，您可以考虑向法院提出异议，并申请重新鉴定或补充鉴定。但这种情况需要充分的证据和理由支持。
行动建议：
- 仔细审查司法鉴定意见：了解鉴定意见的具体内容、依据和结论，以及医嘱在鉴定中的作用和地位。
- 咨询专业律师：如果您对司法鉴定意见或医嘱内容有疑问或不解，建议咨询专业律师，以便更准确地理解鉴定意见和医嘱的法律意义。
- 准备相关证据：如果您认为医嘱内容对案件处理有重要影响，且司法鉴定未充分考虑医嘱内容，您可以准备相关证据（如医嘱记录、执行情况等）以支持您的观点。
法律后果：
- 如果您坚持按照医嘱处理而忽视司法鉴定结果，可能会面临法院不采纳您的主张、判决您承担不利法律后果的风险。
- 因此，在处理医疗纠纷时，建议您尊重司法鉴定的权威性和证明力，并综合考虑医嘱内容、司法鉴定结果以及其他相关证据来制定合理的诉讼策略。
如果您在处理此类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。