公司宿舍抽烟罚1000元是否合理，需结合公司规章制度的制定程序、内容合法性及公示告知情况综合判断，在未满足特定法律条件下，通常是不合理的。以下从不同角度为您详细分析：
一、公司规章制度的制定程序
民主程序要求：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位在制定涉及劳动者切身利益的规章制度时，应当经职工代表大会或全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或职工代表平等协商确定。若公司未履行该程序，直接规定罚款条款，该制度可能因程序违法而无效。
公示告知义务：
- 规章制度必须向劳动者公示或告知。若员工入职时未签署确认书，或公司未通过有效方式（如公告栏、邮件）公示吸烟处罚规定，则罚款缺乏依据。
二、罚款金额的合理性
禁止企业自行设定经济处罚：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条及司法实践，除法定情形外，企业无权直接从工资中扣款作为罚款。地方性法规（如广东）明确规定禁止企业对员工进行罚款。
合理性审查标准：
- 即使公司有权处罚，罚款数额应与违纪行为性质、情节及损失相当。1000元罚款若远超当地最低工资标准（如超过月工资20%），可能被认定为显失公平。例如，若当地最低工资标准为2000元/月，1000元罚款即占月工资的50%，显然不合理。
三、特殊情形下罚款的合法性边界
劳动合同明确约定：
- 若劳动合同中已明确约定吸烟行为的违约责任（如高额违约金），且该约定不违反法律法规强制性规定，公司可据此主张赔偿性违约金而非行政罚款。但需注意，违约金数额也应合理，不能显失公平。
实际损失追偿：
- 若吸烟引发火灾等事故造成公司财产损失，公司可通过民事途径要求员工承担赔偿责任，但需提供证据证明损失金额与吸烟行为的因果关系。此时，赔偿金额应根据实际损失确定，而非随意设定。
四、员工权益保护
- 如果公司对抽烟员工进行了不合法的罚款，员工有权与公司协商要求返还罚款。
- 协商不成时，员工可以向劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
- 在极端情况下，员工甚至可以通过诉讼途径来保护自己的权益。
综合建议：
核查公司规章制度：
- 首先，核查公司是否有关于宿舍抽烟罚款的规章制度，以及该制度是否经过民主程序制定并公示告知。
评估罚款金额合理性：
- 其次，评估罚款金额是否合理，是否远超当地最低工资标准或月工资的20%。
与公司协商或寻求法律帮助：
- 若认为罚款不合理，可与公司协商要求返还罚款；协商不成时，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
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