辞退补偿中的近12月平均工资，计算时采用的是应发工资，而非实发工资。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据与规定

1. 《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条：经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。这里的“月工资”指的是劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
2. 《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条：劳动合同法第四十七条规定的经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。这明确指出了经济补偿的计算基数是应发工资。

二、应发工资与实发工资的区别

1. 应发工资：是劳动者在正常提供劳动的情况下应得的工资报酬，它反映了劳动者的实际劳动贡献和企业的薪酬政策，一般包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、延长工作时间的工资报酬以及特殊情况下支付的工资等。
2. 实发工资：是劳动者实际到手的工资，它可能因个人所得税、社保公积金个人部分、缺勤扣款等因素而低于应发工资。

三、为何以应发工资为计算基数

1. 体现劳动价值：应发工资更全面地反映了劳动者在正常工作时间内的劳动价值，包括基本工资、奖金、津贴等各项收入，能够更准确地衡量劳动者的劳动贡献。
2. 保障劳动者权益：以应发工资为计算基数，能够确保劳动者在获得经济补偿时，其权益得到充分保障，避免因扣除各项费用而导致补偿金额减少，从而维护劳动者的合法权益。
3. 法律规定：如前所述，《中华人民共和国劳动合同法实施条例》明确规定了经济补偿的月工资应按照劳动者应得工资计算，这是具有法律效力的规定。

四、特殊情况下的处理

1. 如果劳动者在劳动合同解除或者终止前12个月的月平均工资低于当地最低工资标准，那么在计算经济补偿时，应当按照当地最低工资标准计算。
2. 如果劳动者工作不满12个月，则按照实际工作的月数计算平均工资。

五、举例说明

假设员工小李的月应发工资为10000元，扣除社保、公积金个人部分及个人所得税后，实发工资为8000元。若公司违法辞退小李，需支付经济赔偿金时，应以10000元作为计算基数，而不是8000元。这样做既符合法律法规的规定，也更能体现对劳动者合法权益的保护。

综上所述，辞退补偿中的近12月平均工资，计算时采用的是应发工资。如果你在劳动工伤领域还有其他问题，可以直接向我咨询。