辞退赔偿工资的计算，主要涉及正常工作期间的工资支付以及经济补偿金的计算，前者按实发工资，后者按应发工资。以下从这两个方面为你详细分析：

正常工作期间的工资支付

根据《劳动合同法》及相关法律法规，员工被单位辞退时，单位应在解除劳动关系后的法定支付周期内，按时足额支付员工在被辞退前按照劳动合同约定的工资标准和工作天数应获得的工资，即实发工资。这是为了确保劳动关系的真正解除，避免后续纠纷。实发工资是劳动者实际收到的工资，即应发工资扣除个人所得税、社会保险费个人缴纳部分、住房公积金个人缴纳部分以及其他可能的扣款（如迟到罚款等）后的净额。

经济补偿金的计算

若因公司原因违法辞退员工，员工除可获得正常工资外，还有权获得经济补偿金。经济补偿金的计算标准通常为员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。关于经济补偿金中月工资的计算基础，应以应发工资为基数。

• 法律依据：

  • 根据《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条明确规定，劳动合同法第四十七条规定的经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。这是因为应发工资更能全面、真实地反映劳动者的劳动价值和收入水平。如果以实发工资作为计算基数，会因扣除项目导致金额低于劳动者实际劳动所得，对劳动者权益造成损害。
  • 同时，劳动者在劳动合同解除或者终止前12个月的平均工资低于当地最低工资标准的，按照当地最低工资标准计算。劳动者工作不满12个月的，按照实际工作的月数计算平均工资。

• 应发工资构成：

  • 基本工资：是劳动者正常出勤并付出正常劳动后应获得的报酬，是工资的主要组成部分。
  • 奖金：包括绩效奖金、年终奖金等，是根据员工的工作表现和业绩来发放的。
  • 津贴和补贴：常见的有交通补贴、通讯补贴、餐补等，是为了弥补员工在工作过程中产生的额外支出或为了保障员工的工作条件而提供的。

• 具体计算示例：

  • 假设员工小张每月基本工资5000元，加上奖金500元和各项补贴300元，那么他的应发工资为5800元。若当月扣除个人所得税100元、社保个人缴纳部分300元、住房公积金个人缴纳部分500元，其实发工资为4900元。在辞退计算经济补偿时，应以5800元（应发工资）为准，而非4900元（实发工资）。

特殊情况说明

• 加班工资是否纳入：如果劳动合同或公司规章制度中明确将加班工资作为计算经济补偿金的基数组成部分，则应将其纳入；若没有明确规定，实践中一般也会将合理的加班工资计算在内，因为加班工资也是劳动者应得劳动报酬的一部分。
• 未实际发放的福利：对于一些已经确定但尚未实际发放的福利，如已确定的年终奖金、季度奖金等，如果在劳动合同解除或终止前已经明确属于劳动者的应得收入，也应计入应发工资范畴来计算经济补偿金。

实际操作建议

• 为避免后续纠纷，建议用人单位和劳动者在劳动合同中明确约定经济补偿金的计算方式。
• 用人单位在辞退员工时，应确保工资的及时、足额发放，并依法支付经济补偿金（如适用），以维护劳动者的合法权益。
• 如果单位未按时足额支付，员工有权向劳动监察大队投诉维权。

综上所述，辞退员工的工资发放应确保正常工作期间的实发工资按时足额支付，而涉及经济补偿金等赔偿计算时，则应以应发工资为基数。如果你在这方面还有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。