结论：在职期间，劳动者完全有权申请劳动仲裁来维护自身合法权益，只要认为自己与用人单位之间存在劳动争议。

详细分析：

1. 法律依据： 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动者与用人单位之间因劳动关系产生的争议，包括但不限于确认劳动关系、订立、履行、变更、解除和终止劳动合同，以及因除名、辞退、辞职、离职，或是工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训、劳动保护以及劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或赔偿金等方面发生的争议，劳动者都有权在知道或应当知道其权利被侵害之日起一年内，向有管辖权的劳动争议仲裁委员会提出书面仲裁申请。

2. 在职期间申请劳动仲裁的考虑因素：

   • 职业发展：在职期间提起仲裁可能会与用人单位产生紧张关系，因此劳动者在决定申请前应综合考虑自身职业发展等多方面因素。
   • 证据收集：为了确保仲裁申请的成功，劳动者需要收集和保存好所有相关证据，包括但不限于劳动合同、工资条、考勤记录等，这些都将作为支持自己仲裁请求的重要依据。
   • 仲裁请求明确：劳动者在提交仲裁申请时，需明确自己的仲裁请求，即希望通过仲裁达到的具体结果，如要求公司支付拖欠的工资、补缴社会保险等。

3. 劳动仲裁的时效限制： 劳动仲裁具有时效限制，通常是在权益受侵害之日起一年内提出。因此，劳动者应及时了解具体的法律规定和程序要求，以确保自己的权益得到有效且及时的保护。

4. 申请劳动仲裁的流程：

   • 准备材料：劳动者需要准备劳动仲裁申请书，详细陈述申请事项和事实理由，并提供相关证据材料。
   • 提交申请：将准备好的材料提交至当地劳动争议仲裁委员会。仲裁委员会在收到申请后，会进行审查并决定是否受理。
   • 开庭审理：如果仲裁委员会决定受理，会安排开庭时间并通知双方当事人。在庭审过程中，双方可以就争议事项进行举证、质证和辩论。
   • 作出裁决：仲裁委员会根据庭审情况和相关法律法规作出裁决。如果支持劳动者的诉求，用人单位需要按照裁决结果履行义务。

建议与后果：

• 建议：如果你在职期间遇到了劳动争议，且认为自己的权益受到了侵害，建议首先尝试与用人单位进行协商解决。如果协商无果，再考虑申请劳动仲裁。在申请前，务必收集好相关证据，并明确自己的仲裁请求。
• 可能后果：如果仲裁裁决支持你的诉求，用人单位需要按照裁决结果履行义务，如支付拖欠的工资、补缴社会保险等。如果用人单位不履行裁决，你可以依法申请法院强制执行。同时，申请劳动仲裁也可能会对你与用人单位的关系产生一定影响，因此在决定申请前应慎重考虑。

总之，在职期间劳动者完全有权申请劳动仲裁来维护自身合法权益。但在行使这一权利时，也应注意相关的法律程序和时限要求，并妥善保留证据以支持自己的主张。如果你有任何法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。