协议中乙方完全可以是两个单位。法律并未对合同关系中乙方的数量做出严格限制，而是根据实际交易或合作的需要来灵活确定。以下从多个角度对此问题进行详细分析：

1. 乙方的数量与身份

   • 灵活性：合同或协议中的乙方数量并非固定，而是根据具体的交易或合作内容来确定。无论是单个实体还是多个实体联合作为乙方，都是合法且常见的。例如，在大型工程项目中，可能有两个或多个施工单位共同作为乙方参与项目。
   • 明确性：虽然可以有多个乙方，但协议中必须清晰、准确地列出所有乙方的身份，包括单位名称、法定代表人或授权代表等信息，以确保合同的合法性和有效性。

2. 权利与义务的分配

   • 共同权利义务：多个乙方可能共同享有合同约定的权益，并共同履行某项责任或义务。例如，在合作开发项目中，两个以上的企业作为联合开发方，会共同出资、共享收益、共担风险。此时，协议中应明确各方的出资比例、收益分配方式以及风险承担机制。
   • 分别权利义务：根据协议的具体规定，多个乙方也可能分别承担不同的权利和义务。这些详细的权利义务分配会在协议条款中明确界定，以避免混淆和纠纷。例如，在采购合同中，可能有两个供应商共同作为乙方提供货物，但各自负责提供不同种类或数量的货物。

3. 乙方之间的关系

   • 关系明确：当存在多个乙方时，协议中需要明确它们之间的关系，比如是连带责任还是按份责任。这有助于在合同履行过程中更好地协调各方利益，并确保责任的合理分配。例如，在连带责任的情况下，任一乙方未履行合同义务，其他乙方均需承担连带责任；而在按份责任的情况下，各乙方仅需承担自己份额内的责任。
   • 避免纠纷：通过详细约定多个乙方各自的权利、义务以及相互之间的关系，可以有效避免未来可能出现的纠纷，保障合同的顺利履行。例如，在协议中明确约定各乙方之间的争议解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。

4. 法律后果与注意事项

   • 法律后果：如果协议中未明确约定多个乙方的权利义务分配或关系，可能导致在合同履行过程中出现纠纷时难以确定责任主体，从而影响合同的顺利履行和各方权益的保护。
   • 注意事项：在签订协议时，务必确保协议中清晰、准确地列出了所有乙方的身份、权利和义务以及它们之间的关系。同时，也要关注协议的合法性和有效性，确保符合相关法律法规的规定。例如，在涉及特定行业或领域的合同时，可能需要遵守特定的行业规范或监管要求。

总结与建议：协议中乙方可以是两个单位，但需确保协议中清晰、准确地列出了所有乙方的身份、权利和义务以及它们之间的关系。在签订协议时，建议咨询专业律师或法律顾问的意见，以确保协议的合法性和有效性，并促进交易的顺利进行。如有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。