动物保护条例的制定与修订通常由国务院及其下属的农业农村部门或林业草原部门负责，具体取决于条例的适用范围和内容。以下是详细说明：

1. 国家层面的动物保护条例
   我国现行的《中华人民共和国野生动物保护法》由全国人民代表大会常务委员会制定，属于法律层级。其修订程序需由全国人大常委会启动，通常由国务院提出修订草案或由全国人大代表提出议案。
   若涉及具体实施细则或配套条例（如《国家重点保护野生动物名录》的调整），则由国务院授权农业农村部、国家林业和草原局等部门制定或修订。例如，农业农村部负责家畜家禽保护相关条例，林业草原部门负责野生动物保护相关条例。

2. 地方性动物保护条例
   省级或市级人大及其常委会可根据本地实际情况制定地方性法规（如《XX省野生动物保护条例》），其修订程序由地方人大启动，通常由地方政府相关部门（如农业农村厅、林业局）起草草案。

3. 部门规章的制定与修订
   若涉及动物保护的具体执行标准（如养殖规范、检疫要求等），可能由农业农村部、国家市场监督管理总局等部门单独或联合制定部门规章。例如，《动物防疫条件审查办法》由农业农村部制定。

关键点总结：

• 法律层级的条例（如《野生动物保护法》）由全国人大修订；
  
• 行政法规或部门规章由国务院或其下属部门修订；
  
• 地方性法规由地方人大修订。
  

若您需要了解某部具体条例的制定主体或修订流程，可直接向我咨询，我会结合条例名称和层级进一步分析。