若税务稽查案件被上级机关检查认为税务处理处罚有问题，一般不能直接重新立案，但可以通过行政复议、行政诉讼等途径寻求救济，同时税务机关内部会启动相应的纠错程序。具体分析如下：

1. 内部纠错程序

   • 重新审查与纠正：上级机关在检查中发现税务处理处罚存在问题时，通常会要求下级税务机关重新审查案件，并根据审查结果进行纠正。这可能包括撤销原处理处罚决定、修改处理处罚幅度或重新作出处理处罚决定等。
   • 内部监督与问责：税务机关内部有严格的监督机制，对于存在问题的税务处理处罚，相关责任人员可能会受到内部问责，以确保税务执法的公正性和准确性。

2. 行政复议途径

   • 申请复议：如果纳税人或扣缴义务人对税务机关的处理处罚决定不服，可以在知道该具体行政行为之日起六十日内提出行政复议申请。行政复议机关将对原处理处罚决定进行全面审查，并作出复议决定。
   • 复议结果：行政复议决定可能维持原处理处罚决定、撤销或变更原决定。如果复议决定撤销或变更了原处理处罚决定，税务机关需要执行复议决定，并可能对原案件进行重新处理。

3. 行政诉讼途径

   • 提起诉讼：如果纳税人或扣缴义务人对行政复议决定仍不服，可以在收到复议决定书之日起十五日内向人民法院提起行政诉讼。人民法院将对税务机关的处理处罚决定进行司法审查，并作出判决。
   • 诉讼结果：人民法院的判决可能维持原处理处罚决定、撤销或变更原决定。如果判决撤销或变更了原处理处罚决定，税务机关需要执行判决，并可能对原案件进行重新处理。但需注意，行政诉讼并非直接“重新立案”的程序，而是对原处理处罚决定的合法性进行审查。

4. 关于“重新立案”的说明

   • 一般情况：在税务稽查案件中，如果上级机关认为原处理处罚存在问题，通常不会直接“重新立案”，而是通过内部纠错程序、行政复议或行政诉讼等途径进行纠正。
   • 特殊情况：如果原案件存在严重的程序违法或实体错误，且无法通过上述途径进行纠正，税务机关可能会考虑重新启动稽查程序。但这种情况较为罕见，且需要严格的法律程序和证据支持。