当您作为被告，面对原告在行政立案后撤诉的情况，您可以按照以下步骤来妥善处理：
一、确认撤诉的真实性与法律效力
首先，您需要通过法院获取正式的撤诉通知或相关裁定文件，这是确认原告撤诉申请已被法院依法准许并完成相应法律程序的关键步骤。只有确保撤诉的真实性和法律效力，您才能进一步采取后续行动。
二、深入了解撤诉原因并评估影响
探究撤诉原因：尝试与原告或通过法院了解撤诉的具体原因。这有助于您评估自身在案件中的处境，以及撤诉可能带来的后续影响，比如是否可能面临原告再次起诉的风险。
评估长期影响：虽然原告撤诉通常意味着本次诉讼程序的终结，但您仍需考虑此次撤诉对您的长期影响，特别是诉讼时效问题。如果原告在诉讼时效内再次提起诉讼，您需要做好应对准备。
三、根据案件阶段采取相应措施
若案件尚处于立案后但未进入实体审理阶段：您可以向法院咨询撤诉原因及后续程序安排，如解除保全措施等。此时，您可以恢复正常生活和工作，但仍需保留好相关证据，以防万一。
若案件已进入实体审理阶段：原告撤诉意味着诉讼程序终止。您无需再参与后续庭审，但需关注法院是否准许撤诉的裁定。如果裁定准许，案件即告终结，双方权利义务关系以撤诉时状态为准。
若案件已进入执行程序：原告撤诉并不影响执行程序的继续。您仍需配合执行法院的工作，履行相应义务，如支付款项、交付财物等。
四、与律师沟通并制定后续策略
如果您之前聘请了律师，现在应该与他们进行深入的沟通。律师可以为您提供专业的建议，帮助您分析撤诉后的法律后果，并为您制定后续的法律策略。这包括是否需要进行进一步的法律行动，以及如何保护您的合法权益。
五、妥善处理和解或其他约定
如果撤诉是基于双方达成了和解协议或庭外和解，您应严格按照约定履行相应义务，并监督原告是否履行其在和解中的承诺。若任何一方不履行约定内容，您可依据和解协议等相关约定，通过合法途径维护自身权益。
六、保留相关文件和证据
即使案件已经撤销，您也应妥善保管所有与案件相关的文件和证据。这些材料在未来的法律纠纷中可能起到关键作用，特别是在原告可能再次提起诉讼的情况下。
七、关注后续发展并调整心态
持续关注：保持警惕，密切关注任何可能的发展。有时候，撤诉并不意味着案件的完全结束，原告可能会在未来采取新的法律行动。
心理与生活调整：从心理上放下因诉讼带来的压力，回归正常的工作和生活节奏。同时，反思自己在案件中的行为和决策，如有必要，采取适当的措施改进业务实践或行为方式，以避免类似的法律纠纷再次发生。
八、合理处理诉讼成本
关于诉讼过程中产生的费用，如律师费、诉讼费等，如果事先有相关约定（例如在合同中约定败诉方承担对方律师费），或者法律有明确规定，您可以按照约定或法律规定要求原告承担合理部分。若无特别约定，一般诉讼费由原告承担，但您为应诉支出的其他合理费用需根据具体情况分析是否有主张让对方承担的依据。
综上所述，面对原告的撤诉，您需要保持冷静和理性，采取一系列措施来妥善应对。通过确认撤诉的真实性与法律效力、深入了解撤诉原因并评估影响、根据案件阶段采取相应措施、与律师沟通并制定后续策略、妥善处理和解或其他约定、保留相关文件和证据、关注后续发展并调整心态以及合理处理诉讼成本，您可以有效地保护自己的合法权益，并降低未来可能发生法律风险的可能性。