在合同中明确约定了违约金的情况下，原则上确实应按照合同约定来执行。但这一原则在实际操作中并非绝对，还需结合法律规定、实际情况以及合同履行的其他因素来综合考量，以确保违约金的合理性与合法性。

首先，从契约精神和法律支持的角度来看，合同是双方当事人意思表示一致的产物，具有法律约束力。违约金条款作为合同的一部分，体现了双方对违约情形及责任承担方式的明确约定。同时，《中华人民共和国民法典》也明确规定了当事人可以约定一方违约时支付一定数额的违约金或损失赔偿额的计算方法，这为违约金条款的效力提供了法律保障。

然而，在实际执行过程中，违约金的合理性需与实际损失相符。如果约定的违约金低于造成的损失，人民法院或仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；如果违约金过分高于造成的损失，则可以适当减少。这是为了防止违约金条款成为一方利用合同优势地位损害另一方利益的工具。

此外，还有一些特殊情况需要考虑。比如，如果合同存在无效或可撤销的法定情形（如欺诈、胁迫、恶意串通等），那么合同自始无效或撤销后，违约金条款也将失去法律约束力。另外，因不可抗力导致无法履行合同的，违约方可不承担民事责任，包括支付违约金，但法律另有规定的除外。

在合同履行过程中，违约金与其他条款的关系也需要注意。比如，合同中若同时约定了违约金和定金条款，违约时只能选择其中一种适用，不能同时要求支付。同时，违约金的性质兼具补偿与惩罚性特征，在判断其是否合理时，需考虑其对守约方损失的补偿程度。

关于违约金的执行方式，如果合同明确约定了违约金金额及支付方式，违约方应按约定直接向守约方支付。合同也可以约定违约金从应付款项中抵扣。在违约金数额调整方面，如果违约金过高或过低，当事人可以请求人民法院或仲裁机构进行适当调整。

最后，如果双方就违约金问题产生争议，应首先尝试通过友好协商解决。如果协商无果，可以根据合同中的仲裁条款向约定仲裁机构申请仲裁，或者向有管辖权的人民法院提起诉讼。在争议解决过程中，应积极提供证据证明自己的主张，以便法院或仲裁机构作出公正裁决。

综上所述，虽然合同明确了违约金原则上应按照合同履行，但在实际操作中需综合考虑多种因素。为避免不必要的法律纠纷与经济损失，建议合同双方在签订合同时就违约金条款进行充分协商和明确约定，并在合同履行过程中严格遵循诚信原则，共同维护良好的商业环境。